28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3728 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1077  hypothetical protein  53.64 
 
 		 631 aa  679    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.866744  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16360  hypothetical protein  75.28 
 
 		 620 aa  957    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3728  hypothetical protein  100 
 
 		 621 aa  1281    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3641  twin-arginine translocation pathway signal  58.4 
 
 		 636 aa  766    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1422  hypothetical protein  75.44 
 
 		 620 aa  955    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1633  hypothetical protein  45.14 
 
 		 634 aa  514  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00578112  normal  0.776269 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1454  twin-arginine translocation pathway signal  42.33 
 
 		 612 aa  428  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3083  FAD dependent oxidoreductase  40.79 
 
 		 650 aa  422  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.620429  normal  0.485634 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1600  twin-arginine translocation pathway signal  42.99 
 
 		 610 aa  412  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0365  hypothetical protein  35.76 
 
 		 644 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0591662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0574  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 		 630 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186923  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4617  hypothetical protein  25.19 
 
 		 650 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1075  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 649 aa  153  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1123  FAD dependent oxidoreductase  51.16 
 
 		 494 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1565  FAD dependent oxidoreductase  46.34 
 
 		 510 aa  48.1  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0651  putative flavin-containing monooxygenase  34.48 
 
 		 500 aa  47.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0962  monooxygenase, flavin-binding family protein  41.86 
 
 		 491 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  47.5 
 
 		 407 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13890  monooxygenase ethA  46.51 
 
 		 498 aa  45.8  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1819  flavin-containing monooxygenase FMO  41.3 
 
 		 505 aa  45.8  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.802985  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5436  FAD dependent oxidoreductase  46.51 
 
 		 489 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.791196 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5683  hypothetical protein  46.51 
 
 		 491 aa  45.8  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00144248 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5145  FAD dependent oxidoreductase  46.51 
 
 		 489 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5057  FAD dependent oxidoreductase  46.51 
 
 		 489 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  39.73 
 
 		 508 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1542  putative monooxygenase  43.9 
 
 		 502 aa  44.3  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.906051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2502  amine oxidase  25.58 
 
 		 557 aa  43.9  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  40.74 
 
 		 488 aa  43.9  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>