16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1791 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1791  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0692  hypothetical protein  40.86 
 
 		 187 aa  150  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.532451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0822  hypothetical protein  42.16 
 
 		 189 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.630868 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4474  hypothetical protein  38.8 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.359543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0792  hypothetical protein  35.44 
 
 		 215 aa  101  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2904  hypothetical protein  32.3 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000387195  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3132  hypothetical protein  30.07 
 
 		 199 aa  94.4  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.213185  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0133  hypothetical protein  31.32 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4149  protein of unknown function DUF925  29.09 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5568  hypothetical protein  27.56 
 
 		 188 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974867  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5933  hypothetical protein  27.56 
 
 		 188 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03666  hypothetical protein  22.55 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1188  hypothetical protein  20.86 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.740448  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2744  hypothetical protein  22.51 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.328055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3208  hypothetical protein  26.82 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000236526  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1468  hypothetical protein  30.41 
 
 		 197 aa  44.7  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000729237  decreased coverage  0.0000188796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>