21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1224 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1224    100 
 
 		 299 bp  593  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.65884  hitchhiker  0.00000296616 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0037  transposase IS66  91.47 
 
 		 1536 bp  168  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.321823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3964  ISPpu14, transposase Orf3  91.47 
 
 		 1536 bp  168  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0893475 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3501  ISPpu14, transposase Orf3  91.23 
 
 		 1536 bp  147  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3981  ISPpu14, transposase Orf3  91.23 
 
 		 1536 bp  147  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0385183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4439  ISPpu14, transposase Orf3  91.23 
 
 		 1536 bp  147  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414491  hitchhiker  0.0000684735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4443  ISPpu14, transposase Orf3  89.43 
 
 		 1536 bp  141  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.801949  hitchhiker  0.0000589528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5396  ISPpu14, transposase Orf3  89.43 
 
 		 1536 bp  141  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118381  hitchhiker  0.00957485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4650    89.34 
 
 		 681 bp  139  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5173  transposase IS66  88.03 
 
 		 1536 bp  121  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51550  putative transposase  87.88 
 
 		 1101 bp  101  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000328821  hitchhiker  0.0000539108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59580  putative transposase  87.88 
 
 		 1536 bp  101  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128729  hitchhiker  1.83127e-18 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3687    84.11 
 
 		 246 bp  77.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1438    84.16 
 
 		 669 bp  73.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4016  ISPpu14, transposase Orf3  91.67 
 
 		 369 bp  63.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1022  transposase IS66  83.95 
 
 		 1560 bp  58  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1401  transposase IS66  83.95 
 
 		 1560 bp  58  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2523  transposase IS66  83.95 
 
 		 1554 bp  58  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0284  hypothetical protein  81.73 
 
 		 213 bp  56  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.750313  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0650  hypothetical protein  94.29 
 
 		 111 bp  54  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3355    88.24 
 
 		 467 bp  54  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>