17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0540 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0540  Cro/CI family transcriptional regulator  100 
 
 		 269 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0552  Cro/CI family transcriptional regulator  95.17 
 
 		 269 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.213682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0497  Cro/CI family transcriptional regulator  96.65 
 
 		 269 aa  513  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0531  Cro/CI family transcriptional regulator  96.28 
 
 		 269 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35470  hypothetical protein  77.94 
 
 		 272 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.030822  hitchhiker  0.00555849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2990  hypothetical protein  77.94 
 
 		 272 aa  421  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0134  helix-turn-helix domain-containing protein  74.26 
 
 		 272 aa  363  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0788  transcriptional regulator  44.79 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2650  transcriptional regulator  45.49 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00061055  normal  0.037615 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0390  hypothetical protein  33.46 
 
 		 266 aa  132  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2182  putative transcriptional regulator  33.77 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293373  normal  0.188357 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4501  helix-turn-helix domain protein  33.04 
 
 		 261 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0769508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6961  XRE family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.512084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6303  hypothetical protein  30.86 
 
 		 322 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.519477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1526  hypothetical protein  30.86 
 
 		 322 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.818031  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1093  XRE family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0872  XRE family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.336664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>