More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2838 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2838  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 
389 aa  790    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2069  8-amino-7-oxononanoate synthase  66.41 
 
 
388 aa  521  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0113  8-amino-7-oxononanoate synthase  67.62 
 
 
394 aa  518  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2429  8-amino-7-oxononanoate synthase  67.36 
 
 
388 aa  504  9.999999999999999e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0079  8-amino-7-oxononanoate synthase  66.32 
 
 
394 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2457  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.05 
 
 
399 aa  479  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2189  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.63 
 
 
388 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1195  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.5 
 
 
382 aa  321  9.999999999999999e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.760383 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.76 
 
 
390 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.21 
 
 
396 aa  299  5e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.43 
 
 
395 aa  296  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4228  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.86 
 
 
395 aa  291  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.323305  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4251  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.32 
 
 
394 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4187  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.4 
 
 
395 aa  288  8e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3949  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.09 
 
 
395 aa  287  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2454  aminotransferase, class I and II  40.45 
 
 
410 aa  286  5.999999999999999e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.658148  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4141  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.35 
 
 
395 aa  285  9e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4026  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.35 
 
 
395 aa  285  9e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4339  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.35 
 
 
395 aa  285  9e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3859  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.35 
 
 
395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.43 
 
 
395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.3 
 
 
395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2130  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.55 
 
 
410 aa  281  2e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2370  aminotransferase, class I and II  41.88 
 
 
409 aa  277  3e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0234318  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0680  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.21 
 
 
385 aa  276  6e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.07 
 
 
391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0328  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.8 
 
 
380 aa  272  6e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.971003  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1659  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.4 
 
 
380 aa  271  1e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0351  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.8 
 
 
380 aa  271  2e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0240485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.34 
 
 
389 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.13 
 
 
389 aa  263  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0027  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.49 
 
 
388 aa  255  8e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.87483 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.64 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.08 
 
 
391 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1387  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.79 
 
 
374 aa  247  2e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1051  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.76 
 
 
398 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.307967  normal  0.238477 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3561  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.09 
 
 
397 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2093  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.93 
 
 
391 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.68 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2856  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.05 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.77 
 
 
397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0031  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.86 
 
 
395 aa  239  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.52 
 
 
386 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.53 
 
 
394 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1662  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.95 
 
 
391 aa  235  8e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.74 
 
 
401 aa  236  8e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0142  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.76 
 
 
407 aa  235  9e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0560736 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0317  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.97 
 
 
385 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.96 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.17 
 
 
391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3534  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.23 
 
 
398 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.89 
 
 
401 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4834  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.07 
 
 
380 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348424 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1029  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.82 
 
 
392 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0067  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.46 
 
 
381 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0065  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.46 
 
 
381 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00162329  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3602  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.51 
 
 
398 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.64 
 
 
397 aa  229  6e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.89 
 
 
390 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1130  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.63 
 
 
396 aa  228  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3452  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.28 
 
 
397 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427892  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.74 
 
 
390 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1326  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.24 
 
 
384 aa  226  7e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3712  aminotransferase, class I and II  37.87 
 
 
385 aa  226  7e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.040259  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2819  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.28 
 
 
386 aa  226  8e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238306 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  32.75 
 
 
395 aa  224  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1570  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.8 
 
 
501 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537635  normal  0.306191 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0613  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.85 
 
 
393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0484  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.6 
 
 
399 aa  222  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0950  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.53 
 
 
367 aa  222  9.999999999999999e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.77 
 
 
395 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1470  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.57 
 
 
402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.000728084  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2897  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.02 
 
 
387 aa  220  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786658  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.87 
 
 
392 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.16 
 
 
399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0886  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.57 
 
 
370 aa  219  6e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2225  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.15 
 
 
395 aa  219  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0363  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.89 
 
 
390 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.15 
 
 
384 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.15 
 
 
396 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2473  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.84 
 
 
389 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00670549  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2068  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.6 
 
 
387 aa  218  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16701  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  35.99 
 
 
379 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.601431  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.15 
 
 
396 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0814  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.38 
 
 
378 aa  217  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0086  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.71 
 
 
368 aa  218  2e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0423  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.2 
 
 
384 aa  216  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0756  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.1 
 
 
394 aa  216  5e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0738  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.84 
 
 
394 aa  215  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0133  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.86 
 
 
392 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4407  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.33 
 
 
395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16481  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  35.21 
 
 
381 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4087  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.96 
 
 
389 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  34.45 
 
 
396 aa  213  5.999999999999999e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0243  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.06 
 
 
389 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0419  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.06 
 
 
389 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014037 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.64 
 
 
391 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1561  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  36.28 
 
 
379 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.158607  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0819  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.9 
 
 
374 aa  211  2e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.11779 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1354  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.55 
 
 
398 aa  211  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000120772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>