210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1750 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1184  hypothetical protein  89.66 
 
 		 357 aa  656    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.965632  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1750  protein of unknown function DUF403  100 
 
 		 357 aa  743    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.594588  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1743  hypothetical protein  85.06 
 
 		 356 aa  627  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.331715  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1064  protein of unknown function DUF403  74.01 
 
 		 354 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1402  hypothetical protein  74.86 
 
 		 360 aa  548  1e-155  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.236553 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0732  protein of unknown function DUF403  74.64 
 
 		 355 aa  546  1e-154  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1492  protein of unknown function DUF403  44.86 
 
 		 335 aa  293  4e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0309521  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3593  protein of unknown function DUF403  44.07 
 
 		 324 aa  278  8e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1033  hypothetical protein  45.77 
 
 		 318 aa  278  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.403724 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4767  protein of unknown function DUF403  44.06 
 
 		 329 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4494  protein of unknown function DUF403  43.12 
 
 		 321 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4430  protein of unknown function DUF403  43.12 
 
 		 321 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0396  protein of unknown function DUF403  42.25 
 
 		 320 aa  259  5.0000000000000005e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.995526 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4414  protein of unknown function DUF403  40.48 
 
 		 334 aa  251  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3275  hypothetical protein  39.7 
 
 		 324 aa  236  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000743183  normal  0.197732 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2255  protein of unknown function DUF403  40.37 
 
 		 317 aa  235  7e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000569022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3760  hypothetical protein  39.76 
 
 		 319 aa  232  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.198455  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15701  hypothetical protein  38.63 
 
 		 324 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.743902  normal  0.307472 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2637  hypothetical protein  37.07 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37252  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2265  hypothetical protein  36.88 
 
 		 327 aa  222  9e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1311  protein of unknown function DUF403  38.44 
 
 		 333 aa  222  9e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.754495  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0732  hypothetical protein  38.01 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.109994  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11431  hypothetical protein  38.82 
 
 		 313 aa  219  7e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11441  hypothetical protein  38.82 
 
 		 313 aa  219  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1050  hypothetical protein  38.82 
 
 		 313 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3875  protein of unknown function DUF403  36.83 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1122  hypothetical protein  36.79 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.225451  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0764  hypothetical protein  37.12 
 
 		 316 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1061  protein of unknown function DUF403  36.48 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.823298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0965  protein of unknown function DUF403  36.48 
 
 		 316 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0328086 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3414  hypothetical protein  35.4 
 
 		 314 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3020  hypothetical protein  37.85 
 
 		 315 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00142607  normal  0.658817 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3402  protein of unknown function DUF403  36.19 
 
 		 318 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.454494  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1207  hypothetical protein  36.08 
 
 		 320 aa  199  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1428  hypothetical protein  34.46 
 
 		 325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0392  hypothetical protein  34.69 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2549  hypothetical protein  36.51 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459959  normal  0.464961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0936  protein of unknown function DUF403  34.35 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4444  protein of unknown function DUF403  35.89 
 
 		 316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1021  hypothetical protein  34.35 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.434907  normal  0.790482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1084  hypothetical protein  36.19 
 
 		 317 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3389  hypothetical protein  34.16 
 
 		 345 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4512  hypothetical protein  34.77 
 
 		 316 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2473  hypothetical protein  36.51 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.353765  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3319  hypothetical protein  33.13 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.846078  normal  0.720686 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2606  hypothetical protein  35.56 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1048  hypothetical protein  34.92 
 
 		 317 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0181882  normal  0.326786 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3156  hypothetical protein  35.44 
 
 		 320 aa  193  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.144051  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1354  hypothetical protein  35.31 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.531652  hitchhiker  0.00962099 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0070  hypothetical protein  34.06 
 
 		 308 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0505568  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2244  protein of unknown function DUF403  33.03 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7511  protein of unknown function DUF403  35.62 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0621482  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0583  hypothetical protein  34.69 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2049  protein of unknown function DUF403  35.53 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0405  hypothetical protein  33.33 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2165  protein of unknown function DUF403  36.51 
 
 		 314 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2057  hypothetical protein  34.57 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.647616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1870  hypothetical protein  32.12 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.088676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4257  hypothetical protein  33.85 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591359  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4109  hypothetical protein  33.85 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00537725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5078  hypothetical protein  32.5 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605764 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4003  hypothetical protein  34.16 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0922511  normal  0.156692 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1941  hypothetical protein  32.81 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572678 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3520  hypothetical protein  33.85 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6764  hypothetical protein  35.31 
 
 		 314 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.360526  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2060  hypothetical protein  32 
 
 		 319 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352485  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3414  hypothetical protein  33.54 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.217438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1935  hypothetical protein  33.85 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37680  hypothetical protein  31.19 
 
 		 316 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.454306  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4108  hypothetical protein  33.54 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0772  hypothetical protein  31.03 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.715045  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1065  hypothetical protein  31.03 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2040  hypothetical protein  31.03 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0798659  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2053  hypothetical protein  31.03 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0646  protein of unknown function DUF403  33.66 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0766  hypothetical protein  31.03 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0675  hypothetical protein  31.03 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1780  hypothetical protein  30.72 
 
 		 313 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2209  hypothetical protein  36.42 
 
 		 314 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2485  protein of unknown function DUF403  36.42 
 
 		 314 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3243  protein of unknown function DUF403  32.72 
 
 		 313 aa  172  9e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.622623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1921  hypothetical protein  30.72 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3012  hypothetical protein  30.43 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.256372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2115  hypothetical protein  33.43 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.107173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3539  hypothetical protein  33.75 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3107  hypothetical protein  30.96 
 
 		 316 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1736  hypothetical protein  30.43 
 
 		 316 aa  169  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2416  hypothetical protein  35.28 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3066  hypothetical protein  30.12 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.417228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1079  hypothetical protein  35.28 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2687  hypothetical protein  30.12 
 
 		 316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0355776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3525  hypothetical protein  32.61 
 
 		 313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2596  hypothetical protein  31.06 
 
 		 316 aa  165  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0574332  normal  0.403817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2239  hypothetical protein  34.58 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.580599  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3217  hypothetical protein  34.58 
 
 		 314 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2197  hypothetical protein  32.32 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.507276  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3051  hypothetical protein  33.66 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1566  hypothetical protein  32.46 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.281936  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5274  hypothetical protein  32.63 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165267 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4481  hypothetical protein  30.67 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>