27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0563 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0563  methyltransferase domain protein  100 
 
 
86 aa  176  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000931916  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1164  methyltransferase domain-containing protein  53.49 
 
 
150 aa  90.5  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0250614  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  36.47 
 
 
210 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5793  Methyltransferase type 11  34.92 
 
 
219 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  32.79 
 
 
263 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4117  methyltransferase type 11  52.27 
 
 
250 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0846884  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  46.34 
 
 
211 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  40 
 
 
220 aa  43.9  0.0008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  48.94 
 
 
236 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  46 
 
 
236 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  46 
 
 
236 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  48.94 
 
 
236 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1418  Methyltransferase type 11  42.55 
 
 
245 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.291463  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  48.94 
 
 
236 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  45.45 
 
 
236 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  48.94 
 
 
236 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  38.18 
 
 
390 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  48.94 
 
 
236 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  48.94 
 
 
236 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  43.9 
 
 
211 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  41.46 
 
 
268 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  52.38 
 
 
222 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  41.86 
 
 
252 aa  41.2  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  41.27 
 
 
226 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  40.91 
 
 
337 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  53.12 
 
 
361 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  35 
 
 
246 aa  40.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>