More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1003 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1003  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 302 aa  620  1e-176  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2690  glycosyl transferase family protein  43.92 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335373 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1403  glycosyl transferase family protein  43.14 
 
 		 301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.508618 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3280  glycosyl transferase family protein  41.67 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3531  glycosyl transferase family protein  39.4 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0234  glycosyl transferase family protein  37.05 
 
 		 336 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2882  glycosyl transferase family protein  39.53 
 
 		 304 aa  202  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0253  glycosyl transferase family protein  36.72 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.186746 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1580  glycosyl transferase family protein  41.22 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2104  glycosyl transferase family protein  38.54 
 
 		 308 aa  199  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0754859  normal  0.466514 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2320  glycosyl transferase family protein  40.88 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2882  glycosyl transferase family protein  40.54 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1290  glycosyl transferase family protein  37.91 
 
 		 321 aa  196  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.127601  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0378  glycosyl transferase family protein  39.29 
 
 		 339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0815  glycosyl transferase family protein  38.8 
 
 		 329 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303571  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2293  glycosyl transferase family protein  39.8 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129801  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1467  glycosyl transferase family protein  40.88 
 
 		 319 aa  192  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0970  glycosyl transferase family protein  37.37 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0885  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 		 324 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2552  glycosyl transferase family protein  38.57 
 
 		 320 aa  192  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0824  glycosyl transferase family protein  38.57 
 
 		 320 aa  192  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.993844 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00767  hypothetical protein  38.57 
 
 		 320 aa  192  6e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2842  Glycosyl transferase, family 3-like protein  38.57 
 
 		 320 aa  192  6e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0855  glycosyl transferase family protein  38.57 
 
 		 320 aa  192  6e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00784  hypothetical protein  38.57 
 
 		 320 aa  192  6e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2843  glycosyl transferase family protein  38.57 
 
 		 320 aa  192  6e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0867  glycosyl transferase family protein  38.57 
 
 		 320 aa  192  7e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0949  glycosyl transferase family protein  38.13 
 
 		 324 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0858  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 		 324 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0917  glycosyl transferase family protein  38.13 
 
 		 324 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2331  glycosyl transferase family protein  38.8 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0852797  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0949  glycosyl transferase family protein  38.44 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0274  glycosyl transferase family protein  37.95 
 
 		 329 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.226663 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2842  glycosyl transferase family protein  38.8 
 
 		 309 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0327  glycosyl transferase family protein  39.67 
 
 		 336 aa  189  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2369  glycosyl transferase family protein  40.98 
 
 		 316 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1780  glycosyl transferase family protein  41.22 
 
 		 319 aa  181  9.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.301488 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1594  glycosyl transferase family protein  41.22 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2397  glycosyl transferase family protein  38.26 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1487  glycosyl transferase family protein  41.22 
 
 		 319 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3296  glycosyl transferase family protein  35.31 
 
 		 304 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0655575  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0575  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596232  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2871  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0490  glycosyl transferase family protein  36.27 
 
 		 369 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4143  glycosyl transferase family protein  37.17 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2494  glycosyl transferase family protein  38.64 
 
 		 322 aa  170  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0305  glycosyl transferase family protein  38.18 
 
 		 322 aa  168  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0738  glycosyl transferase family protein  36.93 
 
 		 354 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0555  glycosyl transferase family protein  36.6 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0570  glycosyl transferase family protein  36.6 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0102  glycosyl transferase family protein  36.6 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3133  glycosyl transferase family protein  36.6 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1487  glycosyl transferase family protein  36.6 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2916  glycosyl transferase family protein  36.6 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6141  glycosyl transferase family protein  36.6 
 
 		 324 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2729  glycosyl transferase family protein  36.42 
 
 		 332 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2197  glycosyl transferase family protein  36.27 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2811  glycosyl transferase family protein  36.27 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2822  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0461  glycosyl transferase family protein  36.01 
 
 		 354 aa  155  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3602  hypothetical protein  31.72 
 
 		 333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30360  hypothetical protein  32.6 
 
 		 327 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2599  hypothetical protein  32.16 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.733501  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3997  hypothetical protein  30.84 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.937914  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1836  hypothetical protein  30.84 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000267985 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3172  hypothetical protein  30.84 
 
 		 333 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102896  normal  0.287439 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3342  glycosyl transferase, putative  31.25 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3579  hypothetical protein  30.4 
 
 		 333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28160  hypothetical protein  29.96 
 
 		 328 aa  109  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2381  hypothetical protein  31.28 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.0161209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3401  hypothetical protein  29.52 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.51245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2358  Anthranilate phosphoribosyltransferase  25.76 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03656  hypothetical protein  27.13 
 
 		 331 aa  92.4  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1665  hypothetical protein  25.55 
 
 		 332 aa  90.5  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2812  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2814  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.17 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10650  anthranilate phosphoribosyltransferase  22.49 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.156426 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1161  hypothetical protein  25.6 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.18822  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1175  anthranilate phosphoribosyltransferase  23.96 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2530  hypothetical protein  26.26 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15730  anthranilate phosphoribosyltransferase  23.11 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.278533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1670  hypothetical protein  26.84 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0478591  normal  0.302071 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001604  glycosyl transferase family 3  23.16 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3637  hypothetical protein  25.94 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2767  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 		 390 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.0391357 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1567  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.35 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.315366  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2471  hypothetical protein  25.52 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0374  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.19 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.250133 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3053  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.41 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29911  hypothetical protein  25.42 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05584  hypothetical protein  22.63 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3065  anthranilate phosphoribosyltransferase  22.27 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00243568  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3246  anthranilate phosphoribosyltransferase  23.08 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00197904  hitchhiker  0.000106883 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1694  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.23 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16170  anthranilate phosphoribosyltransferase  22.12 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0555344  normal  0.866332 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1689  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.43 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.304746  normal  0.0692576 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1598  hypothetical protein  28.21 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1762  Anthranilate phosphoribosyltransferase  24.78 
 
 		 350 aa  65.9  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2006  anthranilate phosphoribosyltransferase  23.81 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.438031  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0513  Anthranilate phosphoribosyltransferase  24.57 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>