32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0694 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0694  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  100 
 
 		 81 aa  162  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4160  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  48.15 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.429167 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3056  hypothetical protein  44 
 
 		 77 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4024  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  41.27 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.738162  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3610  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  41.27 
 
 		 76 aa  52  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.429024  normal  0.027299 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5964  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  41.27 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3976  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  39.68 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00576537  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4391  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  39.68 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7280  SpoVT/AbrB-like cell growth regulatory protein  42.19 
 
 		 75 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0985  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.92 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2540  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.14 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2889  transcriptional regulator, AbrB family  36.92 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0461439  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2509  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.92 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0579  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.07 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4623  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  42.22 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.683129 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4270  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.33 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0902743  normal  0.118236 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3974  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  38.71 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1016  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.71 
 
 		 80 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.110199 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2865  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  31.67 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.191423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2066  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  30.51 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0264  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  45.65 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4702  antitoxin ChpS  37.5 
 
 		 83 aa  41.2  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1229  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  47.5 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1020  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  38.3 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000368524  unclonable  0.00000000295771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1200  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  47.5 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3769  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  43.48 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4793  antitoxin ChpS  43.48 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4477  antitoxin ChpS  43.48 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3308  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  45.65 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5699  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.14 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.815302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3377  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.33 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00170089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0770  PemI-like protein  36.51 
 
 		 84 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>