31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1642 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1642  putative transmembrane protein  100 
 
 		 65 aa  123  9e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.115403  normal  0.943321 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1937  putative transmembrane protein  92.31 
 
 		 65 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0759563  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0366  hypothetical protein  55.74 
 
 		 70 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0429  hypothetical protein  53.33 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3194  hypothetical protein  53.33 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0676  hypothetical protein  53.33 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25557  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2853  hypothetical protein  53.33 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0511  hypothetical protein  53.33 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0493  hypothetical protein  53.33 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1426  hypothetical protein  53.33 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0166  hypothetical protein  53.33 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0222  putative transmembrane protein  55.74 
 
 		 70 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.701084 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0241  hypothetical protein  57.38 
 
 		 70 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0131422 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0317  transmembrane protein  50 
 
 		 74 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0264  hypothetical protein  46.77 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6173  hypothetical protein  47.54 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3822  hypothetical protein  46.77 
 
 		 83 aa  63.5  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.289947 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3178  hypothetical protein  42.62 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00832421  normal  0.330181 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2899  hypothetical protein  45.9 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.869288  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2760  hypothetical protein  45.9 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2854  hypothetical protein  45.9 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2229  hypothetical protein  45.9 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2843  hypothetical protein  45.9 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.238867  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1248  hypothetical protein  39.68 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.353376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0186  hypothetical protein  41.94 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0460  hypothetical protein  41.94 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.23553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4388  hypothetical protein  38.71 
 
 		 69 aa  52.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4168  hypothetical protein  50.82 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.94904 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0548  hypothetical protein  50.82 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0280  hypothetical protein  56.76 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0881  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>