189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1138 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1138  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  100 
 
 		 92 aa  186  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.186492 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0710  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  92.41 
 
 		 115 aa  144  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1275  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  67.53 
 
 		 117 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6554  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  67.53 
 
 		 118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6556  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  67.53 
 
 		 117 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0933451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6162  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  67.53 
 
 		 117 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0784231 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3850  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  74.63 
 
 		 114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6268  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  67.53 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.940336  normal  0.486413 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7062  PhnA protein  71.43 
 
 		 118 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225206  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  73.13 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.678342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0099  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  73.13 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2938  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  67.09 
 
 		 113 aa  105  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  67.95 
 
 		 113 aa  104  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950023  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1747  PhnA protein  74.63 
 
 		 113 aa  103  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0953769  normal  0.26972 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1928  hypothetical protein  62.03 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.035098  normal  0.423433 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1380  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  62.03 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3129  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  63.75 
 
 		 113 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1492  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  62.03 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.301207  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3342  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA, putative  75.81 
 
 		 114 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0482  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  75.81 
 
 		 134 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0257  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  75.81 
 
 		 114 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3011  putative alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  75.81 
 
 		 114 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2082  putative alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  75.81 
 
 		 114 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0286  phnA family protein  75.81 
 
 		 114 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0298  phnA family protein  75.81 
 
 		 114 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3336  putative alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  75.81 
 
 		 114 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3747  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  68.29 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1219  hypothetical protein  65.82 
 
 		 111 aa  99.4  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00756508  normal  0.430256 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3334  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  71.01 
 
 		 113 aa  98.6  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0976  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  71.01 
 
 		 113 aa  98.6  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03979  hypothetical protein  64.56 
 
 		 111 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3884  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  64.56 
 
 		 111 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03940  hypothetical protein  64.56 
 
 		 111 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4609  hypothetical protein  64.56 
 
 		 111 aa  96.7  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4662  hypothetical protein  64.56 
 
 		 111 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4348  hypothetical protein  64.56 
 
 		 111 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3919  hypothetical protein  64.56 
 
 		 111 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4573  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  64.56 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5621  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  64.56 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914109 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2068  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  62.82 
 
 		 113 aa  95.9  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.818906  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4551  hypothetical protein  63.29 
 
 		 111 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4635  hypothetical protein  63.29 
 
 		 111 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4684  hypothetical protein  63.29 
 
 		 111 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.550863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4635  hypothetical protein  63.29 
 
 		 111 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2498  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  62.82 
 
 		 113 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00301412  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4544  hypothetical protein  63.29 
 
 		 111 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0240  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  72.46 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1254  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  62.16 
 
 		 79 aa  92.8  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0192046  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0311  hypothetical protein  60.76 
 
 		 111 aa  92.8  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0235836 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3438  hypothetical protein  55.7 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67162  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1791  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.14 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758561  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0801  PhnA protein  57.14 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.69 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5082  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.69 
 
 		 113 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5080  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.69 
 
 		 113 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4812  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.69 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4654  alkylphosphonate utilization operon protein  57.69 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4674  alkylphosphonate utilization operon protein  57.69 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5177  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.69 
 
 		 113 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.69 
 
 		 113 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5051  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.69 
 
 		 113 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0282  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.14 
 
 		 112 aa  90.9  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.249322 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0160  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.69 
 
 		 113 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1698  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.41 
 
 		 112 aa  90.9  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000832125  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3403  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.89 
 
 		 113 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0097  hypothetical protein  58.33 
 
 		 113 aa  90.1  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0444  alkylphosphonate uptake protein  55 
 
 		 122 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3549  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55 
 
 		 110 aa  89.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1344  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  64 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.204916  normal  0.319142 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0089  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.43 
 
 		 112 aa  88.6  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2917  phnA family protein  62.5 
 
 		 112 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2595  phnA family protein  62.5 
 
 		 112 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2184  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  64.29 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0570  PhnA protein  57.14 
 
 		 112 aa  88.6  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.595887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0958  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  59.49 
 
 		 112 aa  88.2  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0565299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1102  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  59.49 
 
 		 112 aa  88.2  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2525  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.41 
 
 		 112 aa  88.6  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0215423 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4739  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.76 
 
 		 114 aa  87.8  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.191551  normal  0.436041 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18100  PhnA protein  56.41 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0582  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  61.76 
 
 		 112 aa  87  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0411  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.09 
 
 		 112 aa  87  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2382  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  60.27 
 
 		 116 aa  87  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00334109  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2614  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  59.72 
 
 		 134 aa  87  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2239  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.85 
 
 		 112 aa  87  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0863  PhnA protein  55.84 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.563096  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0516  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.85 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01560  hypothetical protein  55.84 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.659368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0204  hypothetical protein  55.84 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360776  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2430  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.43 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101708  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3770  hypothetical protein  58.33 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4283  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  61.76 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0919  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  61.76 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0998  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA, putative  53.16 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29749  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3090  putative alkylphosphonate uptake protein, phnA  54.55 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3817  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.55 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.51996 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0904  PhnA-like protein  57.33 
 
 		 109 aa  84.7  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000000773889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0686  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.58 
 
 		 113 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1478  PhnA protein  58.33 
 
 		 112 aa  84.7  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0718  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.96 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0717  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.69 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125807 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>