15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0563 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0563  hypothetical protein  100 
 
 		 50 aa  106  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1401  hypothetical protein  85.71 
 
 		 184 aa  80.9  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2765  proline rich protein  76.32 
 
 		 202 aa  67  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1165  proline rich protein  73.68 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0221177  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2590  proline rich protein  73.68 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2186  proline rich protein  73.68 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  0.201232 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0678  proline rich protein  73.68 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0831  hypothetical protein  73.53 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3265  hypothetical protein  68.42 
 
 		 227 aa  61.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3731  proline rich protein  74.36 
 
 		 209 aa  60.5  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.655053 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0933  hypothetical protein  64.29 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2377  proline rich protein  72.97 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333429 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3468  hypothetical protein  65.79 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0852278  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2795  hypothetical protein  65.79 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3713  hypothetical protein  58.54 
 
 		 209 aa  57.4  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>