37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0434 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0428  PhoH family protein  80.8 
 
 		 1647 bp  737    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0593193  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0434    100 
 
 		 1634 bp  3239    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.546046 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2309  PhoH-like protein  81.67 
 
 		 1398 bp  95.6  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801738 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2235  PhoH family protein  79.23 
 
 		 1686 bp  95.6  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0299193  hitchhiker  0.000000485186 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1997  PhoH-like protein  77.97 
 
 		 1704 bp  93.7  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1191  PhoH family protein  79.9 
 
 		 1728 bp  77.8  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171726  normal  0.0177982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2392  putative ATPase, PhoH-like protein  86.05 
 
 		 1695 bp  75.8  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0563545 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1795  PhoH family protein  86.05 
 
 		 1851 bp  75.8  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0220004 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0920  PhoH family protein  84.88 
 
 		 1821 bp  67.9  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115039  normal  0.244887 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1222  PhoH-like protein  87.69 
 
 		 1428 bp  65.9  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.408575 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2029  PhoH family protein  84.42 
 
 		 1722 bp  58  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.877213 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5166  PhoH-like protein  82.61 
 
 		 1803 bp  56  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6214  PhoH-like protein  82.61 
 
 		 1803 bp  56  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1865  PhoH family protein  82.61 
 
 		 1803 bp  56  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0641  PhoH family protein  85.94 
 
 		 1431 bp  56  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0328663  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1889  PhoH family protein  82.61 
 
 		 1803 bp  56  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.835175  hitchhiker  0.000000118582 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2686    88.24 
 
 		 1401 bp  54  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.413884 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1728  nucleotide binding protein  85.48 
 
 		 1398 bp  52  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0561726  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1252  PhoH family protein  80.33 
 
 		 1728 bp  52  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00804597  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1827  PhoH family protein  86.79 
 
 		 1788 bp  50.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298411  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1246  PhoH-like protein  93.94 
 
 		 1395 bp  50.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1970  PhoH-like protein  83.12 
 
 		 1695 bp  50.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.368565  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1316  hypothetical protein  90.24 
 
 		 1719 bp  50.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1159  PhoH family protein  81.52 
 
 		 1635 bp  48.1  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.613186  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2282  PhoH family protein  81.52 
 
 		 1635 bp  48.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.293655  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1408  PhoH family protein  81.52 
 
 		 1806 bp  48.1  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.545496  normal  0.312062 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2243  PhoH family protein  81.52 
 
 		 1794 bp  48.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1900    88.64 
 
 		 1403 bp  48.1  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0010  PhoH family protein  81.52 
 
 		 1635 bp  48.1  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1886  PhoH family protein  81.52 
 
 		 1635 bp  48.1  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.44962  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2186  PhoH-like protein  82.14 
 
 		 1689 bp  48.1  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.985404 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2187  PhoH family protein  81.52 
 
 		 1896 bp  48.1  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1185  PhoH family protein  93.75 
 
 		 1410 bp  48.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.940531 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1469  PhoH family protein  93.75 
 
 		 1410 bp  48.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2407  PhoH family protein  81.52 
 
 		 1887 bp  48.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398735  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2754  hypothetical protein  82.5 
 
 		 1407 bp  48.1  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1396  PhoH family protein  81.52 
 
 		 1794 bp  48.1  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>