56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3010 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3010  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  224  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3571  hypothetical protein  88.35 
 
 
103 aa  199  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.985911  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2180  hypothetical protein  79.05 
 
 
105 aa  182  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444997  normal  0.720389 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1453  hypothetical protein  75.24 
 
 
106 aa  179  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1165  hypothetical protein  79.21 
 
 
109 aa  176  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.659614  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2428  hypothetical protein  77.45 
 
 
104 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3001  hypothetical protein  77.45 
 
 
104 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318856  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0521  hypothetical protein  69.9 
 
 
108 aa  159  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3028  hypothetical protein  70.71 
 
 
120 aa  153  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0905  hypothetical protein  62.62 
 
 
117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2903  hypothetical protein  60.4 
 
 
154 aa  132  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.530714  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2555  hypothetical protein  61.05 
 
 
117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.132154  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2831  hypothetical protein  60 
 
 
107 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511648  normal  0.844244 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2425  hypothetical protein  60 
 
 
107 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2764  hypothetical protein  64.52 
 
 
99 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0733  hypothetical protein  55.77 
 
 
155 aa  128  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0376  hypothetical protein  55.77 
 
 
170 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1074  hypothetical protein  55.77 
 
 
170 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0918  hypothetical protein  54.72 
 
 
107 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.62062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0922  hypothetical protein  54.72 
 
 
107 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0676  hypothetical protein  54.72 
 
 
107 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0125  hypothetical protein  54.72 
 
 
107 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2511  hypothetical protein  54.72 
 
 
107 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2552  hypothetical protein  55.45 
 
 
106 aa  124  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2471  hypothetical protein  55.45 
 
 
106 aa  124  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0130577 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2576  hypothetical protein  55.45 
 
 
106 aa  124  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.944303 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1940  hypothetical protein  55.45 
 
 
106 aa  124  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0744  hypothetical protein  54.46 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437314 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5884  hypothetical protein  51.89 
 
 
106 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0530  hypothetical protein  54.84 
 
 
111 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0758  hypothetical protein  51.49 
 
 
113 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3204  hypothetical protein  52 
 
 
114 aa  114  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461134  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1755  hypothetical protein  56.04 
 
 
100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.161099  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1470  hypothetical protein  54 
 
 
104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3034  hypothetical protein  48.96 
 
 
98 aa  92.8  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.233347  normal  0.328557 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2677  hypothetical protein  50 
 
 
120 aa  89  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.913736  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2286  hypothetical protein  42.22 
 
 
107 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.583133  normal  0.55869 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0514  hypothetical protein  37.23 
 
 
98 aa  77  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0538  hypothetical protein  37.23 
 
 
98 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0182  hypothetical protein  35.87 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3387  hypothetical protein  47.56 
 
 
109 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2012  acetyltransferase  35.48 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1392  hypothetical protein  35.16 
 
 
97 aa  74.7  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5222  hypothetical protein  47.56 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4693  hypothetical protein  47.56 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.153331 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0305  hypothetical protein  45.88 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657088  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1853  hypothetical protein  39.08 
 
 
106 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4925  hypothetical protein  46.34 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5343  hypothetical protein  46.34 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.740309  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3023  hypothetical protein  46.34 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0103  hypothetical protein  41.76 
 
 
180 aa  67  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.844457  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0605  hypothetical protein  31.76 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0444  hypothetical protein  31.76 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1914  hypothetical protein  32.14 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2118  hypothetical protein  30.23 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0731714 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2494  hypothetical protein  30.23 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.36203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>