23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2754 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2754  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 141 aa  295  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  86.33 
 
 		 140 aa  252  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1841  cupin 2, barrel  84.17 
 
 		 141 aa  244  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0498378 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  75 
 
 		 144 aa  219  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800776  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2942  hypothetical protein  76.12 
 
 		 144 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3610  cupin 2 domain-containing protein  75.54 
 
 		 144 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1567  hypothetical protein  74.1 
 
 		 140 aa  218  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2367  hypothetical protein  76.26 
 
 		 144 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4635  cupin 2, barrel  74.82 
 
 		 144 aa  215  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3728  cupin 2 domain-containing protein  74.82 
 
 		 144 aa  215  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0858246 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3793  cupin 2 domain-containing protein  74.82 
 
 		 144 aa  215  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.742443  normal  0.0537176 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1216  cupin 2 domain-containing protein  74.07 
 
 		 145 aa  207  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.365458  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4216  cupin 2 domain-containing protein  74.44 
 
 		 138 aa  204  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.014913 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0701  cupin 2 domain-containing protein  70.15 
 
 		 141 aa  202  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0625  cupin 2 domain-containing protein  67.86 
 
 		 151 aa  191  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5282  hypothetical protein  40.98 
 
 		 191 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.274603 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0505  hypothetical protein  42.48 
 
 		 133 aa  90.5  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.51 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0171538  hitchhiker  0.000000529343 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5798  cupin 2 domain-containing protein  32.61 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.99 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1401  hypothetical protein  37.39 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0939  hypothetical protein  34.29 
 
 		 266 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  27.43 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>