21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_R0021 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_R0021  tRNA-Pro  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.979827  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0040  tRNA-Pro  95.89 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.123101  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0007  tRNA-Pro  89.04 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0031  tRNA-Pro  86.3 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000153307  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0031  tRNA-Pro  86.3 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000674228  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0035  tRNA-Pro  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0048  tRNA-Pro  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0035  tRNA-Pro  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124879  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0055  tRNA-Pro  94.12 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000146939  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0035  tRNA-Pro  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000012695  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0042  tRNA-Pro  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000616467  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0008  tRNA-Pro  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152664  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0043  tRNA-Pro  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.411383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0001  tRNA-Pro  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0029  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.264372  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0031  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0087  tRNA-Val  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0058  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210923  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0048  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0013  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.293207  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0054  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>