19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3743 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3743  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  142  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.87408 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09950  hypothetical protein  56.92 
 
 		 67 aa  70.9  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.698592  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4940  hypothetical protein  53.03 
 
 		 69 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1143  hypothetical protein  53.73 
 
 		 69 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12560  hypothetical protein  53.73 
 
 		 69 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0643  hypothetical protein  53.85 
 
 		 67 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4653  hypothetical protein  52.31 
 
 		 67 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.672863  normal  0.338139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4831  hypothetical protein  52.31 
 
 		 67 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4777  hypothetical protein  52.31 
 
 		 67 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.927704  hitchhiker  0.00369137 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2673  hypothetical protein  51.67 
 
 		 76 aa  57  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2500  hypothetical protein  40 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1577  hypothetical protein  54.9 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2565  hypothetical protein  43.55 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382416  normal  0.0961796 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1054  hypothetical protein  43.08 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.127693 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0008  hypothetical protein  46.03 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.301477  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4240  hypothetical protein  42.19 
 
 		 69 aa  50.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2604  hypothetical protein  52.17 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0293  hypothetical protein  45.45 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0231  hypothetical protein  45.9 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>