65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3389 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3389  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 231 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1388  hypothetical protein  78.35 
 
 		 231 aa  325  5e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0883629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16150  hypothetical protein  77.06 
 
 		 231 aa  320  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3822  phage shock protein A, PspA  61.5 
 
 		 236 aa  257  9e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302506  normal  0.194258 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3479  ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6  60.53 
 
 		 229 aa  257  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.111551  normal  0.0139812 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5044  phage shock protein A, PspA  52.42 
 
 		 232 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3786  PspA/IM30 family protein  49.13 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1693  PspA/IM30  49.13 
 
 		 235 aa  191  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.509577  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1224  phage shock protein A, PspA  48.44 
 
 		 226 aa  191  8e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01340  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  48.89 
 
 		 226 aa  181  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02185  PspA/IM30 family protein  46.29 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4191  PspA/IM30 family protein  44.78 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2668  PspA/IM30  46.02 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.638244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3114  phage shock protein A, PspA  44.25 
 
 		 229 aa  170  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.139469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0858  phage shock protein A, PspA  44.25 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.69065  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0827  phage shock protein A, PspA  44.69 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3091  phage shock protein A, PspA  43.36 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0777554  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3482  phage shock protein A, PspA  43.81 
 
 		 229 aa  168  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0916026  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0185  phage shock protein A, PspA  43.42 
 
 		 227 aa  168  7e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3765  hypothetical protein  44.25 
 
 		 229 aa  168  8e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0888  phage shock protein A, PspA  42.92 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0755885  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0912  phage shock protein A, PspA  42.92 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0749469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0922  phage shock protein A, PspA  42.92 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3450  phage shock protein A, PspA  42.92 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.613908  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0623  phage shock protein A, PspA  44.69 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0697  PspA/IM30  43.81 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000488945  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3838  phage shock protein A, PspA  43.36 
 
 		 228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.867887  unclonable  0.00000000015087 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3266  phage shock protein A, PspA  42.04 
 
 		 229 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.942546  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0722  phage shock protein A, PspA  42.92 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000273053  hitchhiker  0.000000222893 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5368  hypothetical protein  41.33 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.813565  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5273  phage shock protein A, PspA  40.44 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0710942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1404  phage shock protein A, PspA  41.33 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.792709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5545  phage shock protein A, PspA  41.33 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892809 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3703  phage shock protein A, PspA  40 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3831  phage shock protein A, PspA  36.4 
 
 		 232 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000771014 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04011  hypothetical protein  36.4 
 
 		 232 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4742  PspA/IM30 family protein  36.4 
 
 		 232 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.473518  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04049  predicted transcriptional regulator effector protein  36.4 
 
 		 232 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3811  phage shock protein A, PspA  36.4 
 
 		 232 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4426  PspA/IM30 family protein  36.4 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4653  PspA/IM30 family protein  36.4 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.618876 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5698  PspA/IM30 family protein  35.53 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4649  PspA/IM30 family protein  36.4 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4732  PspA/IM30 family protein  35.96 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4789  PspA/IM30 family protein  35.96 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4768  PspA/IM30 family protein  35.96 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0677  phage shock protein A, PspA  36.82 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1637  phage shock protein A, PspA  34.63 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0735  phage shock protein A, PspA  34.09 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3183  phage shock protein A, PspA  30.77 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170876  normal  0.95857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2957  PspA/IM30 family protein  30.45 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4514  phage shock protein A, PspA  36.04 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0564095  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2993  phage shock protein A, PspA  34.09 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.403474  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1604  phage shock protein A, PspA  32.3 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768774 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  26.64 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3075  phage shock protein A, PspA  26.49 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000922891  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4580  phage shock protein A, PspA  33.33 
 
 		 233 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0606937  normal  0.0580714 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5260  phage shock protein A, PspA  26.7 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0073418  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  26.09 
 
 		 254 aa  46.2  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  24.62 
 
 		 259 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  26.67 
 
 		 257 aa  42.7  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1270  phage shock protein A, PspA  26.71 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1959  putative phage shock protein A, PspA  26.19 
 
 		 226 aa  42  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0840025  normal  0.0378156 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2298  phage shock protein A, PspA  26.19 
 
 		 226 aa  42  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  25.75 
 
 		 319 aa  42  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>