39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3358 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3358  5'-nucleotidase  100 
 
 		 257 aa  523  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.804755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2771  5'-nucleotidase  62 
 
 		 258 aa  306  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6934  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  40.5 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0297  5'-nucleotidase  38.83 
 
 		 296 aa  135  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0290  5'-nucleotidase  38.83 
 
 		 296 aa  135  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4339  5'-nucleotidase  37.25 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1767  acid phosphatase  36.99 
 
 		 289 aa  128  8.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000413587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4258  acid phosphatase  34.87 
 
 		 275 aa  125  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.641517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4619  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  37.93 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4246  acid phosphatase  34.87 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1746  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  36.45 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4639  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  37.44 
 
 		 275 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.920677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0616  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  37.93 
 
 		 275 aa  121  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4638  acid phosphatase  36.95 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4623  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  34.45 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0924  5'-nucleotidase  34.65 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.663931 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4746  acid phosphatase  35.96 
 
 		 275 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4406  acid phosphatase  35.96 
 
 		 275 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1481  5'-nucleotidase  30.4 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.376876 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1456  5'-nucleotidase  35.04 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1079  acid phosphatase (Class B)  33.04 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000160418  normal  0.248613 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1501  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  33.98 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03615  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  34.45 
 
 		 336 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1069  acid phosphatase class B  32.17 
 
 		 272 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000258294  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28250  putative secreted acid phosphatase  32.71 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1239  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  31.28 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.619067  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2236  acid phosphatase (Class B)  31.17 
 
 		 272 aa  97.8  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0918  acid phosphatase (Class B)  32.31 
 
 		 272 aa  97.8  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2020  secreted acid phosphatase-like protein  33.94 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2497  5'-nucleotidase  32.02 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0188  5'-nucleotidase  30.24 
 
 		 287 aa  92.8  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0053  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  30.36 
 
 		 307 aa  91.7  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127569  normal  0.529666 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0190  5'-nucleotidase  29.27 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0294  acid phosphatase class B  27.39 
 
 		 315 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3380  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  28.71 
 
 		 271 aa  85.9  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000119479  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1332  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  29.77 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1231  acid phosphatase (Class B)  34.64 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000100818  normal  0.0153766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4705  acid phosphatase class B  27.51 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.987217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03813  acid phosphatase  22.13 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>