22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3012 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3012  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.320414  decreased coverage  0.00000000000000430073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24630  hypothetical protein  62.5 
 
 		 93 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2086  hypothetical protein  62.5 
 
 		 73 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1749  hypothetical protein  43.48 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1737  hypothetical protein  38.89 
 
 		 73 aa  64.7  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2135  hypothetical protein  36.36 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.141239  normal  0.38352 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1997  hypothetical protein  34.72 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669002  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2481  hypothetical protein  31.43 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00238478  hitchhiker  0.00335305 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1984  hypothetical protein  43.48 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1055  hypothetical protein  31.94 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.231807  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1131  hypothetical protein  33.33 
 
 		 74 aa  50.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637215  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2958  hypothetical protein  38.89 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1587  hypothetical protein  38.18 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00606067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1804  hypothetical protein  30.43 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00318058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1780  hypothetical protein  31.43 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0375803  normal  0.0296624 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1750  hypothetical protein  31.43 
 
 		 72 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000194255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1675  hypothetical protein  31.43 
 
 		 72 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0116343  normal  0.567132 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2226  hypothetical protein  30.56 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0399077  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2598  hypothetical protein  30 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003434  hypothetical protein  30.56 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.880664  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1101  hypothetical protein  30.56 
 
 		 78 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2807  hypothetical protein  30.88 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.244352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>