15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1749 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1749  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  160  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24630  hypothetical protein  46.38 
 
 		 93 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2086  hypothetical protein  44.93 
 
 		 73 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3012  hypothetical protein  43.48 
 
 		 73 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.320414  decreased coverage  0.00000000000000430073 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1055  hypothetical protein  47.14 
 
 		 72 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.231807  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1737  hypothetical protein  35.21 
 
 		 73 aa  64.3  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2958  hypothetical protein  45.45 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1101  hypothetical protein  40.91 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1131  hypothetical protein  37.68 
 
 		 74 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637215  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1984  hypothetical protein  39.39 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1547  hypothetical protein  36.92 
 
 		 74 aa  50.4  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003434  hypothetical protein  34.85 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.880664  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1997  hypothetical protein  26.15 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669002  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02006  hypothetical protein  26.67 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000861224  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2476  hypothetical protein  34.29 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>