16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1924 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1924  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  383  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2610  hypothetical protein  47.75 
 
 
192 aa  171  5e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1211  hypothetical protein  48.6 
 
 
189 aa  153  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.174889  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0338  hypothetical protein  40.88 
 
 
189 aa  149  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0278088  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0360  hypothetical protein  42.54 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0611863  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0260  hypothetical protein  40.68 
 
 
197 aa  131  6e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0029368  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0334  hypothetical protein  41.34 
 
 
208 aa  122  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.804201  normal  0.829767 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  26.8 
 
 
356 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1232  hypothetical protein  32.26 
 
 
164 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.8 
 
 
356 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.8 
 
 
356 aa  55.5  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3380  protein of unknown function DUF123  34.46 
 
 
153 aa  51.2  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798744  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1038  hypothetical protein  33.12 
 
 
146 aa  48.5  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.4343 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2695  hypothetical protein  27.1 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.13 
 
 
356 aa  44.3  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.1 
 
 
357 aa  43.5  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>