18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4048 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4048  cycloartenol synthase-like protein  100 
 
 		 348 aa  714    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2604  signal peptide-containing protein  57.94 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2435  cycloartenol synthase-like protein  38.35 
 
 		 385 aa  206  7e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1815  cycloartenol synthase-like protein  37.78 
 
 		 385 aa  202  8e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0525  cycloartenol synthase-like protein  35.67 
 
 		 392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6441  hypothetical protein  27.68 
 
 		 522 aa  109  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0306  A-macroglobulin complement component  25.68 
 
 		 827 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813037  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1355  squalene-hopene cyclase  24.7 
 
 		 684 aa  56.6  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.06763 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2003  hypothetical protein  24.44 
 
 		 441 aa  56.2  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0341062  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0829  hypothetical protein  24.32 
 
 		 497 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1685  squalene-hopene cyclase  31.91 
 
 		 649 aa  51.2  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2233  squalene-hopene cyclase  24.78 
 
 		 684 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000414929  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5491  squalene-hopene cyclase  40 
 
 		 645 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.264934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1987  squalene-hopene cyclase-like protein  20.36 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.374107  normal  0.15857 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0632  hypothetical protein  37.31 
 
 		 739 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  28.18 
 
 		 3197 aa  43.1  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4682  hypothetical protein  34.58 
 
 		 523 aa  42.7  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000297224  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1825  squalene-hopene cyclase  38.46 
 
 		 663 aa  42.7  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>