19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3168 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3168  Spore coat protein CotH  100 
 
 		 661 aa  1324    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308168  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2822  spore coat assembly protein-like  26.48 
 
 		 567 aa  92.4  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2180  hypothetical protein  25.36 
 
 		 611 aa  91.3  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.522979  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  28.62 
 
 		 533 aa  88.6  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13030  spore coat assembly protein  25.26 
 
 		 536 aa  82  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0739  spore coat assembly protein-like protein  27.68 
 
 		 495 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1492  spore coat protein CotH  24.61 
 
 		 564 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000146602  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3499  spore coat protein CotH  22.55 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0747833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18680  CotH protein  25.34 
 
 		 485 aa  62.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237965  normal  0.166703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0033  Spore coat protein CotH  26.13 
 
 		 490 aa  62  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0703  spore coat protein CotH  23.39 
 
 		 663 aa  58.9  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0251  Spore coat protein CotH  24.54 
 
 		 679 aa  58.5  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0200884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1405  spore coat assembly protein-like protein  20.11 
 
 		 709 aa  58.5  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.430258  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0099  spore coat protein CotH  25.31 
 
 		 610 aa  58.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158821 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1303  Spore coat protein CotH  26.71 
 
 		 659 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.844218  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3379  spore coat protein CotH  25.12 
 
 		 505 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1143  hypothetical protein  25.16 
 
 		 679 aa  48.9  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.513503  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1817  Spore coat protein CotH  27.88 
 
 		 548 aa  47.8  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.572718 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  44.62 
 
 		 1821 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>