23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2022 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2022  protein of unknown function DUF201  100 
 
 		 425 aa  873    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2608  hypothetical protein  25.59 
 
 		 386 aa  97.4  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0133551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  26.92 
 
 		 366 aa  97.1  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3083  protein of unknown function DUF201  26.68 
 
 		 380 aa  86.7  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0260  hypothetical protein  26.33 
 
 		 403 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1278  hypothetical protein  23.8 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.422818  normal  0.140099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2010  protein of unknown function DUF201  24.11 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  0.206685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3534  hypothetical protein  25 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  26.29 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3151  hypothetical protein  24.54 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5947  hypothetical protein  23.7 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095496 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1523  hypothetical protein  24.75 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6483  hypothetical protein  22.66 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.422069 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2432  hypothetical protein  23.78 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0197  hypothetical protein  22.03 
 
 		 391 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0457  hypothetical protein  23.08 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.764291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6003  protein of unknown function DUF201  25.47 
 
 		 376 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866607  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1659  hypothetical protein  24.5 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.256819  normal  0.444616 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1149  hypothetical protein  21.13 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0371  hypothetical protein  27.65 
 
 		 290 aa  53.9  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000731332  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5779  hypothetical protein  27.43 
 
 		 384 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0168364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1032  hypothetical protein  19.51 
 
 		 353 aa  45.1  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2862  hypothetical protein  21.89 
 
 		 380 aa  43.5  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>