123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1970 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1970  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
186 aa  389  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4211  GCN5-related N-acetyltransferase  27.37 
 
 
313 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189304  normal  0.011866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4378  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  30.68 
 
 
330 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2152  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.67 
 
 
153 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011584  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0292  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.74 
 
 
171 aa  53.1  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00273276 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1061  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.7 
 
 
151 aa  52.8  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288075  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0401  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.89 
 
 
163 aa  52.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0319315 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0149  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.16 
 
 
156 aa  52.4  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182937  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1843  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  42.22 
 
 
164 aa  51.6  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00686227  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1392  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.16 
 
 
148 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000164567  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1774  acetyltransferase  40.3 
 
 
159 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.619579  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3585  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.24 
 
 
160 aa  49.3  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2368  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.12 
 
 
153 aa  48.9  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0240  GCN5-related N-acetyltransferase  35.82 
 
 
299 aa  49.3  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000582767  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0826  putative acetyltransferase  30.93 
 
 
166 aa  48.5  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2515  GCN5-related N-acetyltransferase  41.79 
 
 
270 aa  48.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4510  GCN5-related N-acetyltransferase  44.83 
 
 
204 aa  48.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0032578  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1343  GCN5-related N-acetyltransferase  36.78 
 
 
142 aa  47.4  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280328  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0145  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  34.67 
 
 
166 aa  47.4  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2472  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.84 
 
 
159 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal  0.87758 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10971  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.82 
 
 
131 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0263282  normal  0.176049 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0218  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.19 
 
 
150 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  31.4 
 
 
151 aa  46.6  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0446  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.84 
 
 
147 aa  46.6  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1293  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  38.16 
 
 
159 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.489062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
153 aa  46.2  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2886  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.78 
 
 
159 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0599  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.06 
 
 
163 aa  46.2  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0914549  normal  0.551178 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2567  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.16 
 
 
159 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.203985  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1761  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 
194 aa  45.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2014  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.84 
 
 
160 aa  45.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00106333  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.71 
 
 
162 aa  45.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635704  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4703  GCN5-related N-acetyltransferase  33.8 
 
 
202 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.625988 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2663  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.16 
 
 
159 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.51966  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0451  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  39.71 
 
 
295 aa  45.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.237261  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1294  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.1 
 
 
154 aa  45.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.7344300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0029  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.7 
 
 
176 aa  45.4  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4737  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.26 
 
 
205 aa  45.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.659195  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3709  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.63 
 
 
213 aa  45.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000200619  unclonable  0.000000018593 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1406  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.73 
 
 
170 aa  45.1  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.964873  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0003  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
320 aa  45.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0957  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  34.48 
 
 
176 aa  45.1  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2739  putative acetyltransferase  29.03 
 
 
323 aa  45.1  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2436  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.14 
 
 
201 aa  44.7  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1381  GCN5-related N-acetyltransferase  39.68 
 
 
166 aa  45.1  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2854  metalloendopeptidase, glycoprotease family  45.45 
 
 
891 aa  44.7  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.594224  normal  0.241498 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04248  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  29.81 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.258576  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3626  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.81 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0500841  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1757  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.13 
 
 
160 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0246  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.14 
 
 
145 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  26.79 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0260  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.14 
 
 
145 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.696152  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1771  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  31.65 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4607  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  29.81 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000779076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4968  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  29.81 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00012833  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3684  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  29.81 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.895597  hitchhiker  0.000147746 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4920  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  29.81 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5885  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  29.81 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276325  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04214  hypothetical protein  29.81 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.31912  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0178  GCN5-related N-acetyltransferase  36.21 
 
 
154 aa  43.5  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.502613  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1753  hypothetical protein  40.74 
 
 
154 aa  43.5  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2855  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.28 
 
 
157 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1673  GCN5-related N-acetyltransferase  35.59 
 
 
157 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0181095 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2153  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  37.7 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  36.21 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02392  hypothetical protein  32.86 
 
 
160 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1178  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.07 
 
 
179 aa  43.5  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.165721 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0025  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.7 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0146128 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0351  GCN5-related N-acetyltransferase  37.31 
 
 
154 aa  43.5  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4677  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
168 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068421 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18900  acetyltransferase  43.33 
 
 
274 aa  43.5  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00834372  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0667  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.19 
 
 
152 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000569259  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0380  acetyltransferase  40.35 
 
 
191 aa  42.7  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.335252  hitchhiker  0.000000351254 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3013  GCN5-related N-acetyltransferase  38.98 
 
 
323 aa  42.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.624033  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1216  GCN5-related N-acetyltransferase  36.07 
 
 
301 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0348  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.35 
 
 
144 aa  42.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1099  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.14 
 
 
150 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2898  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 
163 aa  42.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.288447 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1975  GCN5-related N-acetyltransferase  34.43 
 
 
205 aa  42.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.73 
 
 
161 aa  42.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00988632 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0184  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
146 aa  42.7  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.648354  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0911  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.78 
 
 
184 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1068  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.7 
 
 
176 aa  42.4  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.43 
 
 
159 aa  42.4  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0774  GCN5-related N-acetyltransferase  29.76 
 
 
151 aa  42.4  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.60492  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0232  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  33.78 
 
 
147 aa  42  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0234  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  33.78 
 
 
147 aa  42  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0578  GCN5-related N-acetyltransferase  37.29 
 
 
157 aa  42  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  37.7 
 
 
138 aa  42  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0310  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.78 
 
 
147 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0286  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.78 
 
 
147 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3260  acetyltransferase  35.82 
 
 
168 aa  42  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0893  hypothetical protein  34.78 
 
 
337 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0958  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.92 
 
 
173 aa  42  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.452906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3737  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.79 
 
 
149 aa  42  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129008  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1165  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.89 
 
 
188 aa  42  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2725  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  40.68 
 
 
323 aa  41.6  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00719898 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3429  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  31.87 
 
 
297 aa  42  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2689  GCN5-related N-acetyltransferase  31.18 
 
 
151 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0628  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.29 
 
 
195 aa  41.6  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.313725  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>