17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3077 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3077  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  721    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.257575  normal  0.207932 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5522  hypothetical protein  51.9 
 
 		 345 aa  358  7e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1501  hypothetical protein  28.32 
 
 		 329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1501  hypothetical protein  28.02 
 
 		 329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1524  hypothetical protein  28.02 
 
 		 329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3374  aminoglycoside phosphotransferase  26.98 
 
 		 661 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3155  hypothetical protein  28.84 
 
 		 678 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2549  hypothetical protein  26.73 
 
 		 667 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4025  putative 6-phosphofructokinase  25.89 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2557  aminoglycoside phosphotransferase  26.73 
 
 		 667 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.898182  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2512  aminoglycoside phosphotransferase  26.73 
 
 		 667 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3874  hypothetical protein  24.09 
 
 		 380 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104897  normal  0.0811727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8526  hypothetical protein  24.27 
 
 		 322 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0530  hypothetical protein  20.35 
 
 		 334 aa  46.2  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1830  hypothetical protein  24.3 
 
 		 353 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3398  hypothetical protein  27.05 
 
 		 371 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.362896  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4406  hypothetical protein  23.63 
 
 		 367 aa  43.1  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>