90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3013 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3013  MlrC domain-containing protein  100 
 
 
515 aa  1042    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.784284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1406  MlrC domain protein  53.69 
 
 
501 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.513277  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1221  MlrC-like protein  53.12 
 
 
515 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1322  MlrC-like  52.91 
 
 
502 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1194  MlrC-like  52.88 
 
 
506 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1343  hypothetical protein  50.89 
 
 
503 aa  490  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99178  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5259  hypothetical protein  51.59 
 
 
508 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303674  normal  0.119677 
 
 
-
 
NC_003296  RS02129  hypothetical protein  48.69 
 
 
494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7649  MlrC domain-containing protein  50.2 
 
 
498 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428726  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6696  MlrC domain-containing protein  47.32 
 
 
516 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380742  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2942  MlrC domain-containing protein  47.42 
 
 
511 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6174  MlrC domain protein  46.61 
 
 
505 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697276  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1296  MlrC C-terminus family protein  47.9 
 
 
502 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2255  MlrC C-terminus family protein  46.56 
 
 
525 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3068  MlrC domain-containing protein  47.22 
 
 
511 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295091  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3378  MlrC domain-containing protein  50.3 
 
 
515 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0192331  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2285  MlrC C-terminus family protein  46.03 
 
 
512 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.887677  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3102  MlrC domain-containing protein  46.03 
 
 
518 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328821  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1326  MlrC C-terminus family protein  46.03 
 
 
518 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2977  MlrC domain-containing protein  46.03 
 
 
512 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3815  MlrC-like  41.99 
 
 
500 aa  362  6e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0503052 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0397  MlrC-like  40.6 
 
 
499 aa  348  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5513  hypothetical protein  35.8 
 
 
500 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142983  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3464  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  35.54 
 
 
488 aa  263  6.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3774  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  37.06 
 
 
510 aa  259  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4364  MlrC domain-containing protein  30.68 
 
 
527 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6029  MlrC domain-containing protein  34.67 
 
 
488 aa  253  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1587  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  34.61 
 
 
490 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6004  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  34.58 
 
 
498 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4481  hypothetical protein  32.5 
 
 
497 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.313264  normal  0.0111943 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1868  hypothetical protein  34.21 
 
 
491 aa  231  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.720764  normal  0.0278927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1621  hypothetical protein  32.33 
 
 
491 aa  229  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0947431  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4902  MlrC domain protein  33.01 
 
 
492 aa  229  8e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3825  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  33.01 
 
 
492 aa  229  8e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5859  MlrC domain-containing protein  34.94 
 
 
500 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0807432  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7545  hypothetical protein  33.53 
 
 
500 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.525505 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6568  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  34.07 
 
 
496 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102219  hitchhiker  0.00991258 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3711  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  31.7 
 
 
482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21787  hitchhiker  0.00970232 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4266  MlrC domain-containing protein  32.4 
 
 
494 aa  219  7e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4259  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  35.28 
 
 
494 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1557  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  31.77 
 
 
483 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0702  hypothetical protein  31.66 
 
 
489 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.104347  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2560  hypothetical protein  33.47 
 
 
496 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4756  MlrC domain-containing protein  32.73 
 
 
491 aa  217  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6086  MlrC domain-containing protein  34.14 
 
 
500 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0752  hypothetical protein  31.46 
 
 
489 aa  215  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.256842  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6097  MlrC domain-containing protein  33.94 
 
 
500 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2627  MlrC domain-containing protein  34.67 
 
 
503 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.751355  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0762  MlrC domain-containing protein  36.9 
 
 
495 aa  212  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5087  hypothetical protein  32.79 
 
 
482 aa  211  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00418234  normal  0.445331 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4633  hypothetical protein  32.46 
 
 
500 aa  204  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0253146  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6569  MlrC domain-containing protein  33.94 
 
 
492 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0911835 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0897  microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  31.73 
 
 
490 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.14771 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3899  hypothetical protein  30.6 
 
 
489 aa  199  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6625  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  31.05 
 
 
491 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0548728  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1369  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  31.85 
 
 
487 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.504048  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4648  hypothetical protein  30.89 
 
 
497 aa  197  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.381889  normal  0.0618812 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5682  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  29.67 
 
 
491 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0874  microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  31.9 
 
 
487 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1929  MlrC domain-containing protein  28.93 
 
 
507 aa  189  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6244  hypothetical protein  30.57 
 
 
434 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1660  hypothetical protein  28.18 
 
 
552 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4349  hypothetical protein  30.51 
 
 
488 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0684  hypothetical protein  30.28 
 
 
491 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2751  hypothetical protein  29 
 
 
488 aa  182  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00233785  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4334  MlrC domain-containing protein  29.3 
 
 
489 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67984  normal  0.0960828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3571  Microcystin LR degradation protein MlrC  26.76 
 
 
488 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105473 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1428  hypothetical protein  31.13 
 
 
510 aa  173  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996809 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4654  MlrC domain-containing protein  29.76 
 
 
477 aa  173  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  0.119732 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6252  hypothetical protein  29.14 
 
 
488 aa  171  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.179737  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3979  MlrC-like  27.62 
 
 
494 aa  169  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5722  MlrC-like  33.5 
 
 
403 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4776  MlrC domain-containing protein  29.43 
 
 
489 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.76631  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00790  hypothetical protein  30.54 
 
 
509 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3799  MlrC domain-containing protein  30.14 
 
 
499 aa  163  7e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1459  Microcystin LR degradation protein MlrC  32.28 
 
 
498 aa  161  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4101  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  28.85 
 
 
480 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3778  MlrC domain protein  29.13 
 
 
488 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0130  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  27.58 
 
 
524 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.713091 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6012  MlrC domain-containing protein  32.78 
 
 
376 aa  152  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1258  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  31.81 
 
 
561 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.367829  normal  0.015953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1346  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  26.89 
 
 
523 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4051  Microcystin LR degradation protein MlrC  29.23 
 
 
524 aa  144  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3885  hypothetical protein  28.18 
 
 
498 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3062  microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  30.16 
 
 
500 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954396  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4155  MlrC domain-containing protein  28.18 
 
 
498 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.870407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5236  putative microcystin LR degradation protein MlrC  26.15 
 
 
519 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.781031  hitchhiker  0.000000241769 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1717  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  33.24 
 
 
482 aa  137  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.679786  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1696  hypothetical protein  26.4 
 
 
493 aa  128  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6013  hypothetical protein  39.84 
 
 
143 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>