18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1373 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1373  paREP1  100 
 
 
278 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0280  paREP1  91.94 
 
 
273 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.216208  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1545  paREP1  50.56 
 
 
280 aa  241  9e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.972627 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0559  GTP:adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase-like protein  30.67 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1066  nuclease  39.67 
 
 
153 aa  61.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6955  ParB domain protein nuclease  40.91 
 
 
128 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.92637  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1725  nucleoside triphosphate  29.41 
 
 
177 aa  58.9  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0722  nucleotidyl transferase  24.58 
 
 
202 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.233715  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0583  ParB-like nuclease  33.65 
 
 
130 aa  46.2  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000149246  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2111  nuclease  42.03 
 
 
193 aa  46.2  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0162  nucleotidyl transferase  26.51 
 
 
202 aa  45.8  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.998873  normal  0.168869 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0179  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  41.67 
 
 
196 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0188224  normal  0.479388 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0184  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  41.67 
 
 
196 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1604  nuclease  31.71 
 
 
168 aa  45.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.32 
 
 
534 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.46 
 
 
355 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.86 
 
 
355 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1038  conserved hypothetical protein  25.15 
 
 
164 aa  43.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>