43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1221 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1221  ABC transporter for copper permease protein  100 
 
 		 264 aa  521  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0165  membrane protein  75.1 
 
 		 261 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2761  hypothetical protein  73.2 
 
 		 263 aa  362  4e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.0518932 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1498  hypothetical protein  67.8 
 
 		 262 aa  361  7.0000000000000005e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.660987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1827  hypothetical protein  71.77 
 
 		 261 aa  357  8e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1592  hypothetical protein  67.56 
 
 		 261 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2272  hypothetical protein  68.36 
 
 		 255 aa  348  7e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000140028  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1952  hypothetical protein  67.45 
 
 		 278 aa  347  9e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3685  hypothetical protein  58.89 
 
 		 269 aa  301  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0659  hypothetical protein  56.71 
 
 		 503 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201808 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1088  protein of unknown function DUF1538  54.22 
 
 		 506 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0802  protein of unknown function DUF1538  55.46 
 
 		 503 aa  249  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3466  hypothetical protein  52 
 
 		 495 aa  244  9e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1220  hypothetical protein  47.08 
 
 		 244 aa  217  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.210254 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1953  hypothetical protein  48.41 
 
 		 245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2271  hypothetical protein  44.02 
 
 		 245 aa  205  7e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00372269  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1591  hypothetical protein  43.24 
 
 		 244 aa  202  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1497  hypothetical protein  44.57 
 
 		 244 aa  202  6e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3684  hypothetical protein  50.4 
 
 		 248 aa  201  9e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2762  hypothetical protein  43.41 
 
 		 244 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  normal  0.055304 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1826  hypothetical protein  41.76 
 
 		 244 aa  195  7e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.299788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0164  membrane protein  47.52 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.634614  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3478  hypothetical protein  38.52 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611874 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0800  protein of unknown function DUF1538  35.51 
 
 		 497 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3479  hypothetical protein  34 
 
 		 245 aa  135  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405509 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0341  protein of unknown function DUF1538  34.63 
 
 		 230 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766414 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0474  hypothetical protein  30.86 
 
 		 245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3139  membrane spanning protein  35.22 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0342  protein of unknown function DUF1538  29.8 
 
 		 253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510639 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0745  hypothetical protein  35.22 
 
 		 231 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189103  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0475  hypothetical protein  34.2 
 
 		 230 aa  118  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0746  hypothetical protein  30.6 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0127316  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2615  hypothetical protein  27.27 
 
 		 508 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0107308  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0101  hypothetical protein  29.92 
 
 		 601 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0338  hypothetical protein  29.82 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322383  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2378  hypothetical protein  40.14 
 
 		 646 aa  103  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1143  protein of unknown function DUF1538  26.14 
 
 		 497 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150487  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0908  protein of unknown function DUF1538  26.32 
 
 		 507 aa  99  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0017  hypothetical protein  26.48 
 
 		 620 aa  97.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000261883  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0337  hypothetical protein  30.42 
 
 		 232 aa  95.9  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0876004  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1723  protein of unknown function DUF1538  33.05 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1786  protein of unknown function DUF1538  29.15 
 
 		 545 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0836999  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0323  hypothetical protein  27.18 
 
 		 481 aa  70.1  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0750362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>