42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1072 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1072  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  258  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105151  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3192  hypothetical protein  47.62 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0660225  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2386  hypothetical protein  43.24 
 
 		 146 aa  90.5  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002785  hypothetical protein  44.26 
 
 		 146 aa  87.8  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2872  hypothetical protein  45.45 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1747  hypothetical protein  45.1 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2497  hypothetical protein  38.14 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.404496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1788  hypothetical protein  38.14 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1825  hypothetical protein  38.14 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0194222  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1781  hypothetical protein  38.14 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0111743  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1645  hypothetical protein  35.48 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1753  hypothetical protein  45.24 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.819388  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03196  hypothetical protein  44.14 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2167  hypothetical protein  44.58 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02145  hypothetical protein  34.75 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0123559  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2486  hypothetical protein  39.67 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1839  hypothetical protein  34.13 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  0.17507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2421  hypothetical protein  45.21 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0112375  hitchhiker  0.000913176 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1647  hypothetical protein  45.21 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2349  hypothetical protein  45.21 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0136957  decreased coverage  0.000000000361738 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1693  hypothetical protein  37.21 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337002  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1969  hypothetical protein  36.75 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00366875  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2439  hypothetical protein  37.39 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685345 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1980  hypothetical protein  35.59 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2248  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0557  Protein of unknown function DUF2069, membrane  37.8 
 
 		 120 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0706  putative transmembrane protein  32.11 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.445384  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3070  transmembrane protein  31.53 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  hitchhiker  0.000683085 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1915  hypothetical protein  36.84 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.130481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1666  hypothetical protein  30.63 
 
 		 130 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.361842  hitchhiker  0.00498054 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0981  membrane protein-like protein  30 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4967  membrane protein-like protein  34.62 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0866  membrane protein-like protein  29 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.060146  normal  0.425014 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1557  hypothetical protein  29.6 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1454  membrane protein  32.61 
 
 		 130 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1432  membrane protein  32.61 
 
 		 130 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0972  membrane protein  32.61 
 
 		 130 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269392  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0898  translation elongation factor Tu  39.39 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000668063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2990  membrane protein-like  31.82 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1375  membrane protein  32.97 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.743719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1335  membrane protein-like protein  31.87 
 
 		 129 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1669  membrane protein-like protein  28.83 
 
 		 135 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>