13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2287 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2287  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  430  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5125  hypothetical protein  33.67 
 
 
210 aa  100  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1080  hypothetical protein  31.65 
 
 
226 aa  84.7  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.796518  normal  0.575608 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09833  fumarate hydratase  26.91 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1645  hypothetical protein  26.57 
 
 
216 aa  71.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1766  hypothetical protein  27.27 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.19576  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1850  hypothetical protein  28.06 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.771027  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01799  hypothetical protein  23.27 
 
 
252 aa  64.3  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0129739  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2212  hypothetical protein  27.83 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.734712  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4168  hypothetical protein  26.94 
 
 
232 aa  62  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3042  hypothetical protein  23.79 
 
 
213 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0371  hypothetical protein  29.17 
 
 
282 aa  52  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0291878 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2417  hypothetical protein  24.19 
 
 
199 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>