More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1849 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  43.21 
 
 
3470 aa  776    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  40.81 
 
 
2820 aa  667    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  41.7 
 
 
2174 aa  720    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  43.39 
 
 
4317 aa  746    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  42.45 
 
 
4468 aa  811    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  39.61 
 
 
5953 aa  740    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  44.19 
 
 
6889 aa  780    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  39.64 
 
 
2385 aa  856    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  42.64 
 
 
4336 aa  728    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  43.14 
 
 
4317 aa  752    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  46.92 
 
 
2625 aa  843    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  52.57 
 
 
2151 aa  1016    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  36.66 
 
 
2875 aa  764    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  46.44 
 
 
5929 aa  855    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  37 
 
 
1753 aa  645    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  36.1 
 
 
3432 aa  688    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  38.5 
 
 
4531 aa  717    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  39.55 
 
 
2385 aa  856    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  39.07 
 
 
2385 aa  850    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  39.74 
 
 
2385 aa  858    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  54.8 
 
 
1405 aa  1428    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  47.36 
 
 
6176 aa  863    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  36.79 
 
 
3328 aa  655    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  46.19 
 
 
4968 aa  932    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  39.43 
 
 
3021 aa  651    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1793  amino acid adenylation  35.89 
 
 
1370 aa  672    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0250793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  40.74 
 
 
4336 aa  713    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  40.24 
 
 
1789 aa  671    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  47.17 
 
 
2666 aa  822    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  52.57 
 
 
2154 aa  1032    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  36.65 
 
 
2883 aa  756    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  45.6 
 
 
5926 aa  843    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  42.47 
 
 
9498 aa  796    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  39.36 
 
 
5372 aa  653    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  41.99 
 
 
5469 aa  668    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  39.37 
 
 
13537 aa  691    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  41.3 
 
 
6676 aa  764    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  45.87 
 
 
2867 aa  907    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  39.28 
 
 
1518 aa  729    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  38.79 
 
 
1142 aa  720    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  41.47 
 
 
3308 aa  765    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  41.29 
 
 
3498 aa  763    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  37.92 
 
 
2386 aa  825    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  40.5 
 
 
2033 aa  731    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  39.23 
 
 
5596 aa  689    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  38.18 
 
 
1786 aa  661    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  37.7 
 
 
1093 aa  668    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  35.31 
 
 
1436 aa  718    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  48.84 
 
 
5230 aa  850    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  39.06 
 
 
2386 aa  854    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  47.99 
 
 
3331 aa  901    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  36.94 
 
 
1816 aa  734    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  42.42 
 
 
6072 aa  826    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  42.91 
 
 
4572 aa  813    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  37.22 
 
 
3291 aa  651    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  43.66 
 
 
5654 aa  791    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  43.63 
 
 
4502 aa  811    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  100 
 
 
1383 aa  2821    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  40.87 
 
 
4882 aa  670    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  39.78 
 
 
3002 aa  674    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  36.67 
 
 
1369 aa  654    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  42.22 
 
 
4332 aa  740    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  37.04 
 
 
3395 aa  677    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  39.55 
 
 
2385 aa  856    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  42.57 
 
 
4037 aa  748    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  42.72 
 
 
1138 aa  758    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  37.95 
 
 
1801 aa  676    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  37.31 
 
 
3348 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  39.78 
 
 
4290 aa  650    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  39.04 
 
 
4489 aa  735    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  43.47 
 
 
4342 aa  751    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  42.11 
 
 
3432 aa  782    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  40.54 
 
 
1129 aa  719    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2091  amino acid adenylation domain-containing protein  40.88 
 
 
1145 aa  715    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2968  amino acid adenylation domain-containing protein  33.39 
 
 
1331 aa  654    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2415  amino acid adenylation domain-containing protein  39.06 
 
 
1127 aa  662    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  38.55 
 
 
3176 aa  641    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  38.68 
 
 
2370 aa  710    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  43.39 
 
 
4342 aa  749    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  44.26 
 
 
5149 aa  798    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  43.65 
 
 
2189 aa  789    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  48.6 
 
 
2448 aa  1169    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  44.16 
 
 
6081 aa  838    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  39.66 
 
 
4383 aa  662    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  38.42 
 
 
6661 aa  755    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  43.55 
 
 
1569 aa  855    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  52.44 
 
 
3942 aa  1051    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  35.96 
 
 
3291 aa  714    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  54.43 
 
 
4991 aa  1078    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  34.8 
 
 
1363 aa  646    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  45.21 
 
 
8914 aa  832    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  38.61 
 
 
2125 aa  653    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  36.79 
 
 
3352 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  44.16 
 
 
4136 aa  800    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  33.74 
 
 
1833 aa  672    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  39.06 
 
 
8646 aa  664    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  39.56 
 
 
8915 aa  666    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  36.96 
 
 
2156 aa  720    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  36.74 
 
 
6006 aa  654    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  43.49 
 
 
4317 aa  751    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>