39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0709 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0709  protein of unknown function DUF1528  100 
 
 		 485 aa  998    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3051  protein of unknown function DUF1528  35.27 
 
 		 478 aa  271  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3687  putative helicase  46.59 
 
 		 398 aa  246  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4049  relaxase  28.27 
 
 		 560 aa  219  8.999999999999998e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4118  relaxase  37.5 
 
 		 569 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0400  relaxase  39.8 
 
 		 570 aa  153  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361957  normal  0.0772849 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3357  helicase/Zfx/Zfy transcription activation region domain-containing protein  29.72 
 
 		 551 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3034  hypothetical protein  32.2 
 
 		 575 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.877854  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1422  hypothetical protein  30.88 
 
 		 634 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114874  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0831  hypothetical protein  30.91 
 
 		 642 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3339  relaxase  32.9 
 
 		 569 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0733  relaxase  29.91 
 
 		 318 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1792  hypothetical protein  29.25 
 
 		 640 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2962  relaxase  32.61 
 
 		 595 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0694  Relaxase  31.88 
 
 		 615 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0425  Relaxase  30.29 
 
 		 599 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60130  hypothetical protein  30.47 
 
 		 639 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829078  hitchhiker  0.00000000146114 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2405  hypothetical protein  31.44 
 
 		 612 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4529  relaxase  30.04 
 
 		 643 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0932  Relaxase  31.44 
 
 		 616 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2175  relaxase  31.44 
 
 		 614 aa  102  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4433  relaxase  29.18 
 
 		 639 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0568  relaxase  29.63 
 
 		 623 aa  98.6  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1173  hypothetical protein  31.73 
 
 		 615 aa  98.2  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1245  relaxase  31.1 
 
 		 627 aa  98.2  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1614  Relaxase  29.88 
 
 		 593 aa  97.4  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2872  Relaxase  31.25 
 
 		 615 aa  97.1  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0649581  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4190  relaxase  29.69 
 
 		 617 aa  93.6  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136156  normal  0.342151 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2364  relaxase  30.64 
 
 		 680 aa  90.5  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000606357  hitchhiker  0.000030776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3435  relaxase  31.58 
 
 		 621 aa  89  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428865 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36580  Relaxase-related protein  30.04 
 
 		 631 aa  89  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2772  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 861 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3950  relaxase  26.32 
 
 		 624 aa  76.6  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0583286  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1387  relaxase  29.67 
 
 		 660 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5472  hypothetical protein  28.47 
 
 		 611 aa  57.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0952115 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2854  hypothetical protein  25.24 
 
 		 445 aa  53.5  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2994  hypothetical protein  24.88 
 
 		 445 aa  53.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4329  hypothetical protein  30.36 
 
 		 408 aa  43.9  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2691  protein of unknown function DUF1528  24.6 
 
 		 282 aa  43.9  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>