89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4633 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4633  hypothetical protein  100 
 
 		 500 aa  992    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0253146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4349  hypothetical protein  45.45 
 
 		 488 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0897  microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  45.64 
 
 		 490 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0874  microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  46.93 
 
 		 487 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5087  hypothetical protein  45.15 
 
 		 482 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00418234  normal  0.445331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1369  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  45.19 
 
 		 487 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.504048  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1557  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  44.74 
 
 		 483 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1428  hypothetical protein  44.99 
 
 		 510 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1621  hypothetical protein  43.79 
 
 		 491 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0947431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0684  hypothetical protein  45.29 
 
 		 491 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3711  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  42.33 
 
 		 482 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21787  hitchhiker  0.00970232 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1868  hypothetical protein  42.92 
 
 		 491 aa  350  3e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.720764  normal  0.0278927 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0702  hypothetical protein  40.2 
 
 		 489 aa  344  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.104347  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0752  hypothetical protein  39.8 
 
 		 489 aa  342  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.256842  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3899  hypothetical protein  39.68 
 
 		 489 aa  332  9e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4648  hypothetical protein  39.26 
 
 		 497 aa  323  6e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.381889  normal  0.0618812 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6625  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  39.23 
 
 		 491 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0548728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2751  hypothetical protein  41.48 
 
 		 488 aa  317  4e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00233785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5682  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  39.02 
 
 		 491 aa  317  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6244  hypothetical protein  39.58 
 
 		 434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5513  hypothetical protein  31.81 
 
 		 500 aa  219  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142983  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1322  MlrC-like  32.53 
 
 		 502 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1587  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  31.25 
 
 		 490 aa  190  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1221  MlrC-like protein  32.19 
 
 		 515 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3013  MlrC domain-containing protein  32.46 
 
 		 515 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784284 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3774  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  32.72 
 
 		 510 aa  182  9.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1343  hypothetical protein  33.73 
 
 		 503 aa  182  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99178  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02129  hypothetical protein  33.53 
 
 		 494 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1406  MlrC domain protein  31.65 
 
 		 501 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.513277  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6029  MlrC domain-containing protein  31.31 
 
 		 488 aa  179  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6568  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  29.21 
 
 		 496 aa  179  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102219  hitchhiker  0.00991258 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2627  MlrC domain-containing protein  32.8 
 
 		 503 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.751355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6004  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  30.75 
 
 		 498 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5259  hypothetical protein  31.52 
 
 		 508 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303674  normal  0.119677 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4364  MlrC domain-containing protein  28.66 
 
 		 527 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3464  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  31.65 
 
 		 488 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6696  MlrC domain-containing protein  32.18 
 
 		 516 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4481  hypothetical protein  28.86 
 
 		 497 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.313264  normal  0.0111943 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4266  MlrC domain-containing protein  32.19 
 
 		 494 aa  172  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1296  MlrC C-terminus family protein  32.39 
 
 		 502 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2942  MlrC domain-containing protein  32.39 
 
 		 511 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2255  MlrC C-terminus family protein  32.59 
 
 		 525 aa  170  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5859  MlrC domain-containing protein  31.05 
 
 		 500 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0807432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7649  MlrC domain-containing protein  31.96 
 
 		 498 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3825  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  30.1 
 
 		 492 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4902  MlrC domain protein  30.1 
 
 		 492 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3815  MlrC-like  31.1 
 
 		 500 aa  166  9e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0503052 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4756  MlrC domain-containing protein  32.25 
 
 		 491 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3068  MlrC domain-containing protein  32.59 
 
 		 511 aa  163  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295091  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6174  MlrC domain protein  30.69 
 
 		 505 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1194  MlrC-like  30.36 
 
 		 506 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2560  hypothetical protein  28.46 
 
 		 496 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6252  hypothetical protein  28.51 
 
 		 488 aa  161  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.179737  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4334  MlrC domain-containing protein  29.08 
 
 		 489 aa  160  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67984  normal  0.0960828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4259  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  30.65 
 
 		 494 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4654  MlrC domain-containing protein  27.85 
 
 		 477 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  0.119732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1660  hypothetical protein  28.48 
 
 		 552 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6097  MlrC domain-containing protein  30.71 
 
 		 500 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6086  MlrC domain-containing protein  31.04 
 
 		 500 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7545  hypothetical protein  30.06 
 
 		 500 aa  153  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.525505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4776  MlrC domain-containing protein  30.48 
 
 		 489 aa  151  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.76631  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3885  hypothetical protein  30.25 
 
 		 498 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0762  MlrC domain-containing protein  31.93 
 
 		 495 aa  151  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1346  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  28.19 
 
 		 523 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6569  MlrC domain-containing protein  30.26 
 
 		 492 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0911835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5236  putative microcystin LR degradation protein MlrC  30.43 
 
 		 519 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.781031  hitchhiker  0.000000241769 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3378  MlrC domain-containing protein  32.25 
 
 		 515 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0192331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4155  MlrC domain-containing protein  29.84 
 
 		 498 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.870407 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3571  Microcystin LR degradation protein MlrC  26.55 
 
 		 488 aa  141  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3979  MlrC-like  29.59 
 
 		 494 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0130  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  28.57 
 
 		 524 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.713091 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2977  MlrC domain-containing protein  29.53 
 
 		 512 aa  136  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3102  MlrC domain-containing protein  29.53 
 
 		 518 aa  136  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328821  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1326  MlrC C-terminus family protein  29.53 
 
 		 518 aa  136  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4101  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  25.26 
 
 		 480 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0397  MlrC-like  30.59 
 
 		 499 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2285  MlrC C-terminus family protein  29.38 
 
 		 512 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.887677  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1929  MlrC domain-containing protein  29.91 
 
 		 507 aa  130  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3799  MlrC domain-containing protein  29.59 
 
 		 499 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00790  hypothetical protein  28.46 
 
 		 509 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5722  MlrC-like  31.27 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4051  Microcystin LR degradation protein MlrC  30.57 
 
 		 524 aa  124  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1717  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  28.11 
 
 		 482 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.679786  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1696  hypothetical protein  25 
 
 		 493 aa  124  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3778  MlrC domain protein  25.05 
 
 		 488 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1459  Microcystin LR degradation protein MlrC  29.34 
 
 		 498 aa  110  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3062  microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  26.11 
 
 		 500 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6012  MlrC domain-containing protein  28.16 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1258  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  26.45 
 
 		 561 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.367829  normal  0.015953 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>