292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3135 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3135  arsenate reductase  100 
 
 		 141 aa  283  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.743459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  94.33 
 
 		 317 aa  271  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2539  arsenate reductase  78.99 
 
 		 143 aa  226  6e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.220394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0324  arsenate reductase  75.89 
 
 		 141 aa  223  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4174  arsenate reductase  74.47 
 
 		 145 aa  223  6e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181376  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2404  arsenate reductase  78.26 
 
 		 142 aa  223  9e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.118806  normal  0.0241288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0617  arsenate reductase  75.35 
 
 		 142 aa  222  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0215  arsenate reductase  73.05 
 
 		 142 aa  222  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3418  arsenate reductase  74.64 
 
 		 141 aa  221  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3125  arsenate reductase  72.34 
 
 		 141 aa  221  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3865  arsenate reductase  73.05 
 
 		 145 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.335288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0876  arsenate reductase  75.74 
 
 		 145 aa  218  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5723  arsenate reductase  72.46 
 
 		 141 aa  217  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1910  arsenate reductase  73.76 
 
 		 141 aa  217  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4053  arsenate reductase  73.76 
 
 		 141 aa  216  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5683  arsenate reductase  70.92 
 
 		 141 aa  214  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2243  arsenate reductase  71.94 
 
 		 144 aa  214  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.565091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1048  arsenate reductase  71.63 
 
 		 141 aa  213  9e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5055  arsenate reductase  72.66 
 
 		 143 aa  212  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3199  arsenate reductase  65.96 
 
 		 141 aa  211  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0696  arsenate reductase  71.63 
 
 		 145 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.739002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0521  arsenate reductase  72.34 
 
 		 141 aa  209  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232672 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2812  arsenate reductase  72.66 
 
 		 140 aa  206  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1379  arsenate reductase  69.5 
 
 		 145 aa  205  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0683447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1971  arsenate reductase  68.84 
 
 		 146 aa  202  9e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1525  arsenate reductase  72.86 
 
 		 140 aa  201  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.085223  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2219  arsenate reductase  69.57 
 
 		 143 aa  201  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0329  arsenate reductase  70 
 
 		 140 aa  200  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.705444 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7178  arsenate reductase  67.86 
 
 		 140 aa  200  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0491  arsenate reductase  69.34 
 
 		 140 aa  197  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1961  arsenate reductase  67.15 
 
 		 148 aa  197  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0302  arsenate reductase  67.63 
 
 		 140 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0336269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6066  arsenate reductase  65.47 
 
 		 140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30670  arsenate reductase  67.88 
 
 		 140 aa  193  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0647  arsenate reductase  68.61 
 
 		 140 aa  192  9e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4072  arsenate reductase  70.21 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124746  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02434  arsenate reductase  64.75 
 
 		 162 aa  191  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.94591  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0102  arsenate reductase  64.54 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5710  arsenate reductase  63.04 
 
 		 140 aa  191  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2161  arsenate reductase  66.19 
 
 		 140 aa  190  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.757721  normal  0.741171 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2418  arsenate reductase  64.75 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2586  arsenate reductase  67.88 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.399241  normal  0.117903 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6300  arsenate reductase  63.77 
 
 		 140 aa  187  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.743402  normal  0.39419 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3966  arsenate reductase  65.69 
 
 		 144 aa  187  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.662339 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1283  arsenate reductase  66.42 
 
 		 140 aa  186  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.884735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5671  arsenate reductase  65.94 
 
 		 140 aa  186  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2461  arsenate reductase  64.03 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.255465  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3114  arsenate reductase  63.04 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00627  arsenate reductase  66.41 
 
 		 137 aa  181  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205854  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2315  arsenate reductase  64.96 
 
 		 140 aa  181  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.509444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4201  arsenate reductase  67.94 
 
 		 138 aa  180  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3830  arsenate reductase  62.22 
 
 		 158 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.720829  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2345  arsenate reductase  62.22 
 
 		 158 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0221987  hitchhiker  0.00279499 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6564  arsenate reductase  60.58 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2288  arsenate reductase  64.23 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.402748  hitchhiker  0.00391371 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2389  arsenate reductase  62.14 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2198  arsenate reductase  62.04 
 
 		 137 aa  177  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.580845  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4662  arsenate reductase  67.18 
 
 		 134 aa  176  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4429  arsenate reductase  63.36 
 
 		 134 aa  176  9e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1214  arsenate reductase  60.14 
 
 		 151 aa  176  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3818  arsenate reductase  60.43 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03352  arsenate reductase  60.43 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0211  arsenate reductase  60.43 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0213  arsenate reductase  60.43 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.592565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3705  arsenate reductase  60.43 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.556229  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03305  hypothetical protein  60.43 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3986  arsenate reductase  60.43 
 
 		 141 aa  174  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4257  arsenate reductase  59.42 
 
 		 141 aa  173  9e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.339282 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3795  arsenate reductase  59.71 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256132 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1977  arsenate reductase  63.36 
 
 		 139 aa  171  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.224843  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4852  arsenate reductase  58.99 
 
 		 141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1992  arsenate reductase  65.65 
 
 		 139 aa  168  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0718  arsenate reductase  56.83 
 
 		 141 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0377236 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2534  arsenate reductase  65.29 
 
 		 121 aa  166  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2343  arsenate reductase  65.87 
 
 		 276 aa  166  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2244  arsenate reductase  62.31 
 
 		 132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.134877  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1785  arsenate reductase  59.38 
 
 		 141 aa  160  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0225096 
 
 
-
 
NC_004310  BR0989  arsenate reductase ArsC, putative  66.96 
 
 		 115 aa  159  9e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0953  putative arsenate reductase  55.22 
 
 		 136 aa  158  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0957  arsenate reductase  66.09 
 
 		 115 aa  158  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1465  arsenate reductase  54.48 
 
 		 134 aa  157  5e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0674  arsenate reductase  51.91 
 
 		 152 aa  147  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.587242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2102  arsenate reductase  49.64 
 
 		 140 aa  142  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.250849  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1913  arsenate reductase  53.49 
 
 		 132 aa  140  8e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1181  arsenate reductase  52 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3399  arsenate reductase  62.07 
 
 		 116 aa  139  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1852  arsenate reductase  51.75 
 
 		 127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3857  arsenate reductase  52.99 
 
 		 143 aa  130  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3127  putative arsenate reductase  51.49 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0590  arsenate reductase and related  48.94 
 
 		 140 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0605  arsenate reductase and related  48.94 
 
 		 140 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.756451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3564  arsenate reductase  55.26 
 
 		 125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.602811  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2887  arsenate reductase  55.75 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.514096  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1593  arsenate reductase  52.63 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2520  arsenate reductase  54.78 
 
 		 116 aa  125  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782751  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2988  arsenate reductase  55.26 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.527919  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0559  arsenate reductase  52.68 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2652  arsenate reductase  51.3 
 
 		 113 aa  122  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.569962  normal  0.394172 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2798  arsenate reductase and related  53.04 
 
 		 127 aa  120  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.762473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0915  arsenate reductase  54.78 
 
 		 125 aa  120  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>