28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0565 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0565  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  145  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0777478 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0814  hypothetical protein  77.94 
 
 		 68 aa  116  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.616088 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2872  hypothetical protein  78.79 
 
 		 67 aa  113  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0972  hypothetical protein  69.7 
 
 		 67 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2632  hypothetical protein  69.7 
 
 		 67 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0084  hypothetical protein  68.18 
 
 		 67 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3522  hypothetical protein  60.94 
 
 		 67 aa  97.4  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.252753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3894  hypothetical protein  58.21 
 
 		 68 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.796989  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3300  hypothetical protein  57.58 
 
 		 68 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0880  hypothetical protein  57.58 
 
 		 68 aa  88.6  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0825  hypothetical protein  57.58 
 
 		 68 aa  88.6  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4218  hypothetical protein  58.21 
 
 		 68 aa  86.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.093569 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3267  hypothetical protein  57.58 
 
 		 68 aa  85.5  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3025  hypothetical protein  53.73 
 
 		 68 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347057  normal  0.478414 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4355  hypothetical protein  50.75 
 
 		 71 aa  77.8  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0302  domain of unknown function DUF1737  50.75 
 
 		 68 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.196664 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1972  hypothetical protein  43.08 
 
 		 67 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2632  hypothetical protein  51.02 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242666  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0511  domain of unknown function DUF1737  53.19 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00417633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0958  hypothetical protein  53.19 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.42475  normal  0.045384 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1418  domain of unknown function DUF1737  38.89 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3858  hypothetical protein  46.81 
 
 		 171 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3643  domain of unknown function DUF1737  45.83 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5839  hypothetical protein  47.06 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4340  hypothetical protein  48.94 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.945633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5021  hypothetical protein  47.06 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111857  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3650  uncharacterized conserved small protein-like protein  48.94 
 
 		 63 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2226  hypothetical protein  38.89 
 
 		 58 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.198629  normal  0.401262 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>