24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0084 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0084  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0972  hypothetical protein  91.04 
 
 		 67 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2632  hypothetical protein  91.04 
 
 		 67 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3522  hypothetical protein  76.12 
 
 		 67 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.252753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2872  hypothetical protein  70.15 
 
 		 67 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0565  hypothetical protein  68.18 
 
 		 68 aa  103  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0777478 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0825  hypothetical protein  67.65 
 
 		 68 aa  98.2  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3300  hypothetical protein  67.65 
 
 		 68 aa  98.2  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0880  hypothetical protein  67.65 
 
 		 68 aa  98.2  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0814  hypothetical protein  64.62 
 
 		 68 aa  96.3  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.616088 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3894  hypothetical protein  67.65 
 
 		 68 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.796989  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4218  hypothetical protein  67.65 
 
 		 68 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.093569 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3267  hypothetical protein  64.71 
 
 		 68 aa  94  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3025  hypothetical protein  64.71 
 
 		 68 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347057  normal  0.478414 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1972  hypothetical protein  55.22 
 
 		 67 aa  84.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4355  hypothetical protein  55.88 
 
 		 71 aa  78.2  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0302  domain of unknown function DUF1737  56.92 
 
 		 68 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.196664 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2632  hypothetical protein  44.9 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242666  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0511  domain of unknown function DUF1737  44 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00417633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3643  domain of unknown function DUF1737  45.83 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1418  domain of unknown function DUF1737  42 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3650  uncharacterized conserved small protein-like protein  45.83 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3858  hypothetical protein  43.75 
 
 		 171 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0958  hypothetical protein  42.11 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.42475  normal  0.045384 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>