28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3894 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3894  hypothetical protein  100 
 
 
68 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.796989  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4218  hypothetical protein  94.12 
 
 
68 aa  137  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.093569 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3025  hypothetical protein  83.82 
 
 
68 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347057  normal  0.478414 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0880  hypothetical protein  77.61 
 
 
68 aa  117  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3300  hypothetical protein  77.61 
 
 
68 aa  117  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0825  hypothetical protein  77.61 
 
 
68 aa  117  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3267  hypothetical protein  71.64 
 
 
68 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4355  hypothetical protein  70.59 
 
 
71 aa  105  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0972  hypothetical protein  67.65 
 
 
67 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2632  hypothetical protein  67.65 
 
 
67 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0084  hypothetical protein  67.65 
 
 
67 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0302  domain of unknown function DUF1737  58.82 
 
 
68 aa  92  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.196664 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0565  hypothetical protein  58.21 
 
 
68 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0777478 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1972  hypothetical protein  58.82 
 
 
67 aa  90.1  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2872  hypothetical protein  58.82 
 
 
67 aa  88.2  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3522  hypothetical protein  61.54 
 
 
67 aa  85.1  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.252753  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0814  hypothetical protein  51.52 
 
 
68 aa  77.4  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.616088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0511  domain of unknown function DUF1737  52 
 
 
79 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00417633  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2632  hypothetical protein  44.9 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242666  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3643  domain of unknown function DUF1737  47.92 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3650  uncharacterized conserved small protein-like protein  54.17 
 
 
63 aa  51.6  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3858  hypothetical protein  45.83 
 
 
171 aa  50.8  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1418  domain of unknown function DUF1737  42.86 
 
 
62 aa  50.4  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4340  hypothetical protein  60 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.945633  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5021  hypothetical protein  55.26 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111857  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5839  hypothetical protein  55.26 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0958  hypothetical protein  47.92 
 
 
64 aa  47.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.42475  normal  0.045384 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2226  hypothetical protein  47.22 
 
 
58 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.198629  normal  0.401262 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>