24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2226 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2226  hypothetical protein  100 
 
 		 58 aa  120  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.198629  normal  0.401262 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4340  hypothetical protein  59.18 
 
 		 66 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.945633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5021  hypothetical protein  60.42 
 
 		 68 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111857  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5839  hypothetical protein  60.42 
 
 		 68 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3643  domain of unknown function DUF1737  55.32 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1418  domain of unknown function DUF1737  50 
 
 		 62 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0511  domain of unknown function DUF1737  46.15 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00417633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3858  hypothetical protein  54.35 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2632  hypothetical protein  54.17 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242666  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0958  hypothetical protein  46.81 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.42475  normal  0.045384 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4355  hypothetical protein  47.06 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3650  uncharacterized conserved small protein-like protein  45.65 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3300  hypothetical protein  51.43 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0825  hypothetical protein  51.43 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0880  hypothetical protein  51.43 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3025  hypothetical protein  45.1 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347057  normal  0.478414 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0302  domain of unknown function DUF1737  41.18 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.196664 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1972  hypothetical protein  43.14 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3894  hypothetical protein  45.1 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.796989  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4218  hypothetical protein  45.1 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.093569 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2872  hypothetical protein  37.25 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0565  hypothetical protein  35.29 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0777478 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3267  hypothetical protein  37.25 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0814  hypothetical protein  39.02 
 
 		 68 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.616088 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>