28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0511 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0511  domain of unknown function DUF1737  100 
 
 
79 aa  157  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00417633  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3643  domain of unknown function DUF1737  65.62 
 
 
92 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3858  hypothetical protein  74.51 
 
 
171 aa  84  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3650  uncharacterized conserved small protein-like protein  72.92 
 
 
63 aa  75.1  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0958  hypothetical protein  65 
 
 
64 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.42475  normal  0.045384 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4340  hypothetical protein  67.35 
 
 
66 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.945633  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5021  hypothetical protein  67.35 
 
 
68 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111857  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5839  hypothetical protein  67.35 
 
 
68 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1972  hypothetical protein  60 
 
 
67 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1418  domain of unknown function DUF1737  51.06 
 
 
62 aa  63.2  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4355  hypothetical protein  56 
 
 
71 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2632  hypothetical protein  57.69 
 
 
66 aa  60.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242666  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0302  domain of unknown function DUF1737  54 
 
 
68 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.196664 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3267  hypothetical protein  59.46 
 
 
68 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3894  hypothetical protein  52 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.796989  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4218  hypothetical protein  52 
 
 
68 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.093569 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3025  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347057  normal  0.478414 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3300  hypothetical protein  53.85 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0880  hypothetical protein  53.85 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0825  hypothetical protein  53.85 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2226  hypothetical protein  42.22 
 
 
58 aa  53.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.198629  normal  0.401262 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2632  hypothetical protein  46 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0565  hypothetical protein  53.19 
 
 
68 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0777478 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0972  hypothetical protein  46 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0084  hypothetical protein  44 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0814  hypothetical protein  46.81 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.616088 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3522  hypothetical protein  42 
 
 
67 aa  44.3  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.252753  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2872  hypothetical protein  42.86 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>