18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2240 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2240  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  136  7.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.261162 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1947  hypothetical protein  97.22 
 
 
72 aa  115  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0293  hypothetical protein  74.29 
 
 
76 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2604  hypothetical protein  43.75 
 
 
69 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2673  hypothetical protein  55.81 
 
 
76 aa  51.2  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0643  hypothetical protein  47.06 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2565  hypothetical protein  54.55 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382416  normal  0.0961796 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12560  hypothetical protein  47.06 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4653  hypothetical protein  45.1 
 
 
67 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.672863  normal  0.338139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4777  hypothetical protein  45.1 
 
 
67 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.927704  hitchhiker  0.00369137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1143  hypothetical protein  47.06 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784924  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4831  hypothetical protein  45.1 
 
 
67 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09950  hypothetical protein  44.44 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.698592  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4240  hypothetical protein  40 
 
 
69 aa  47  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4940  hypothetical protein  47.06 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2500  hypothetical protein  46 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1577  hypothetical protein  39.06 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303774 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0231  hypothetical protein  38.98 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>