19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1942 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1942  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  196  7.999999999999999e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1122  hypothetical protein  48.81 
 
 
85 aa  96.3  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0215  hypothetical protein  43.01 
 
 
100 aa  94  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0436  hypothetical protein  46.97 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.889027  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03065  hypothetical protein  41.05 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0155  hypothetical protein  42.03 
 
 
109 aa  55.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123262  hitchhiker  0.0000255316 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2328  hypothetical protein  34.07 
 
 
126 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00898416  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2656  hypothetical protein  44.12 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.482309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3746  hypothetical protein  37.84 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277012  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6828  hypothetical protein  34.74 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4277  hypothetical protein  37.84 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3623  hypothetical protein  32.63 
 
 
183 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2354  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.907944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1249  hypothetical protein  28.57 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00737651  normal  0.251434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26500  hypothetical protein  32.89 
 
 
300 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.407608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0790  hypothetical protein  29.87 
 
 
92 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1722  hypothetical protein  31.94 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3751  hypothetical protein  32.97 
 
 
289 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3956  hypothetical protein  32.43 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>