45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1938 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1938  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  167  4e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2082  hypothetical protein  62.3 
 
 
82 aa  92  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.106415  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2829  hypothetical protein  38.46 
 
 
81 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493287  normal  0.100972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2568  hypothetical protein  38.46 
 
 
84 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5336  hypothetical protein  32.93 
 
 
86 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4917  hypothetical protein  31.58 
 
 
86 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.969012  hitchhiker  0.00139076 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0325  hypothetical protein  29.76 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5877  hypothetical protein  32.26 
 
 
86 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0311  hypothetical protein  30 
 
 
86 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399436  decreased coverage  0.00561451 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000196  hypothetical protein  35.59 
 
 
80 aa  50.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000484737  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0291  hypothetical protein  30 
 
 
86 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3173  hypothetical protein  38.89 
 
 
79 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67900  hypothetical protein  30.65 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0525665  normal  0.0342115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4895  hypothetical protein  29.27 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0316  hypothetical protein  29.33 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02128  hypothetical protein  29.33 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.555122  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1233  hypothetical protein  41.07 
 
 
79 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.9486  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05926  hypothetical protein  30.51 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3645  hypothetical protein  32.39 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1923  hypothetical protein  33.87 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3744  hypothetical protein  31.51 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0278  hypothetical protein  37.68 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0596635  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1901  hypothetical protein  32.1 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04610  hypothetical protein  26.25 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4266  hypothetical protein  41.51 
 
 
85 aa  43.9  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0504269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3073  hypothetical protein  35 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0320515  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2420  hypothetical protein  29.17 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0761064  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1987  hypothetical protein  35 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3039  hypothetical protein  35 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2987  hypothetical protein  35 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2119  hypothetical protein  35 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0325664  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2625  hypothetical protein  35 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.65052  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0793  hypothetical protein  35 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1573  hypothetical protein  30.14 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.330992  normal  0.269924 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4254  hypothetical protein  24.69 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233068 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3322  hypothetical protein  28.77 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2026  hypothetical protein  31.94 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00481823  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3643  hypothetical protein  33.33 
 
 
98 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1564  hypothetical protein  33.33 
 
 
103 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0710  hypothetical protein  37.04 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3727  hypothetical protein  32.73 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3339  hypothetical protein  27.4 
 
 
82 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2302  hypothetical protein  21.33 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3665  hypothetical protein  27.4 
 
 
82 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4081  hypothetical protein  31.15 
 
 
88 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40971  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>