20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3032 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_3032  hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  761    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31543e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3263  hypothetical protein  48.51 
 
 
381 aa  350  3e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.521841 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0717  hypothetical protein  37.06 
 
 
429 aa  246  4e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1781  hypothetical protein  39.78 
 
 
377 aa  239  6.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.44232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2308  hypothetical protein  38.86 
 
 
424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2728  hypothetical protein  39.52 
 
 
439 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283161  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3651  hypothetical protein  38.13 
 
 
455 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2702  hypothetical protein  37.84 
 
 
583 aa  219  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532123  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4493  hypothetical protein  37.03 
 
 
557 aa  215  9e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2842  hypothetical protein  36.22 
 
 
440 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290516 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2217  hypothetical protein  37.37 
 
 
451 aa  197  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122466  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2693  hypothetical protein  25.97 
 
 
405 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.658833  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08440  hypothetical protein  28.34 
 
 
457 aa  57.8  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.696595  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08410  hypothetical protein  23.88 
 
 
444 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1305  hypothetical protein  24.76 
 
 
454 aa  55.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.364108  normal  0.63665 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09860  hypothetical protein  24.16 
 
 
453 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.726307  normal  0.031392 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1801  hypothetical protein  25.13 
 
 
465 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1086  hypothetical protein  25.68 
 
 
429 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0399  hypothetical protein  25 
 
 
484 aa  43.5  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1012  protein of unknown function DUF404  25.33 
 
 
482 aa  43.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0541998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>