21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0996 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0996  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  100 
 
 		 78 aa  161  3e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1782  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  68.49 
 
 		 76 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0270712 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0432  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  70 
 
 		 74 aa  108  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1688  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  70 
 
 		 74 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.240785  normal  0.273394 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1360  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  52.11 
 
 		 76 aa  85.5  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.151364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1939  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  60 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000133233  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1566  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  52 
 
 		 51 aa  53.9  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1151  RNA-binding protein Nop10p  52 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.871506  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0076  RNA-binding protein Nop10p  50 
 
 		 51 aa  53.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.592689 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1801  nucleolar RNA-binding protein Nop10p  48.94 
 
 		 53 aa  48.9  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2024  RNA-binding protein Nop10p  48.94 
 
 		 56 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0415  nucleolar RNA-binding protein Nop10p  47.83 
 
 		 60 aa  48.9  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161206  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1397  nucleolar RNA-binding protein Nop10p  46 
 
 		 56 aa  46.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0139355  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2561  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  47.83 
 
 		 54 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.510114 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1856  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  41.51 
 
 		 53 aa  45.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.875885 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0958  RNA-binding protein Nop10p  47.92 
 
 		 49 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.351379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2603  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  50 
 
 		 55 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1127  nucleolar RNA-binding protein Nop10p  43.48 
 
 		 49 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0965  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  46 
 
 		 51 aa  41.2  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.496122  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1008  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  44.9 
 
 		 52 aa  41.2  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1700  H/ACA RNA-protein complex component Nop10p  44 
 
 		 51 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.274563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>