More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0564 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2233  malate dehydrogenase  86.37 
 
 		 434 aa  769    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.70342  normal  0.683923 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0564  malate dehydrogenase  100 
 
 		 434 aa  872    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1691  malate dehydrogenase  88.91 
 
 		 434 aa  775    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.145089  normal  0.0768004 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0373  malate dehydrogenase  68.84 
 
 		 448 aa  602  1.0000000000000001e-171  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0671  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  63.1 
 
 		 432 aa  538  9.999999999999999e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.13637  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0031  malate dehydrogenase  61.41 
 
 		 428 aa  514  1.0000000000000001e-145  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.399579  normal  0.119769 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1054  malate dehydrogenase  60.4 
 
 		 422 aa  493  9.999999999999999e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.767504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0985  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  54.33 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000205214  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2446  malate dehydrogenase  44.94 
 
 		 491 aa  390  1e-107  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0229  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  49.61 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0830  malate dehydrogenase  50.25 
 
 		 403 aa  354  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.313277  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0967  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  45.04 
 
 		 407 aa  350  2e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1376  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  47.79 
 
 		 478 aa  348  9e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000390692  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0409  malate dehydrogenase  47.01 
 
 		 403 aa  345  7e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0344  malate dehydrogenase  47.17 
 
 		 390 aa  345  8e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318957  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2232  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  47.01 
 
 		 478 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1110  malate dehydrogenase  48.75 
 
 		 481 aa  342  8e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421684  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0169  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  47.96 
 
 		 387 aa  341  1e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3045  NAD-dependent malic enzyme  46.36 
 
 		 427 aa  340  2e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.900825  normal  0.491141 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0140  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  48.1 
 
 		 503 aa  339  7e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0617  putative malate dehydrogenase  44.8 
 
 		 399 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2399  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  44.64 
 
 		 399 aa  337  2.9999999999999997e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000325026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4722  putative malate dehydrogenase  44.55 
 
 		 399 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0642  malate dehydrogenase, putative  45.45 
 
 		 399 aa  335  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2923  malate dehydrogenase  46.74 
 
 		 414 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3145  malate dehydrogenase  46.74 
 
 		 414 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2866  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  47.79 
 
 		 489 aa  335  1e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0548  malate dehydrogenase  44.55 
 
 		 399 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0579  malate dehydrogenase  44.55 
 
 		 399 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1956  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  43.77 
 
 		 390 aa  334  2e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0409  malate dehydrogenase  43.64 
 
 		 383 aa  333  4e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192997  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3134  putative malate dehydrogenase  47.01 
 
 		 414 aa  333  4e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1062  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  50.12 
 
 		 407 aa  333  5e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00425454  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0465  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  46.63 
 
 		 467 aa  332  6e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0490  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  45.2 
 
 		 399 aa  332  9e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0635  putative malate dehydrogenase  45.2 
 
 		 399 aa  332  9e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0492  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  45.2 
 
 		 399 aa  332  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1792  malate dehydrogenase  44.16 
 
 		 409 aa  332  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  42.29 
 
 		 756 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  42.29 
 
 		 756 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1758  malate dehydrogenase  44.16 
 
 		 409 aa  332  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0298  malic enzyme  42.29 
 
 		 756 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000250182 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1919  malate oxidoreductase  44.13 
 
 		 387 aa  329  7e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000616521  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1265  NADP-dependent malic enzyme, putative  41.63 
 
 		 409 aa  328  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0215  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  46.52 
 
 		 392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.984607  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2869  malic enzyme  42.29 
 
 		 761 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000177126 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0296  malate dehydrogenase  43.61 
 
 		 489 aa  327  2.0000000000000001e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.491674 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3287  malate dehydrogenase  46.06 
 
 		 412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  43.58 
 
 		 760 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0220  malic enzyme  41.59 
 
 		 756 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.667581  hitchhiker  0.000000000555006 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0245  malic enzyme  41.82 
 
 		 756 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000009441 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3674  malic enzyme  43.58 
 
 		 760 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0789225  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0237  malic enzyme  41.82 
 
 		 756 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0019  malic enzyme  41.82 
 
 		 773 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3417  malic enzyme  41.82 
 
 		 756 aa  326  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154841  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3849  malic enzyme  41.82 
 
 		 756 aa  326  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2586  malic enzyme  41.82 
 
 		 756 aa  326  6e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10480  malic enzyme  45.32 
 
 		 493 aa  326  6e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.549836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3524  malic enzyme  41.82 
 
 		 756 aa  326  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753922  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3123  malic enzyme  41.82 
 
 		 756 aa  326  6e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1969  malic enzyme  41.82 
 
 		 756 aa  326  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3533  malic enzyme  41.82 
 
 		 756 aa  326  6e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78558  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  41.82 
 
 		 756 aa  326  6e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1534  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  46.23 
 
 		 423 aa  325  9e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4433  malate dehydrogenase  44.07 
 
 		 412 aa  325  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0524  putative malate dehydrogenase  44.31 
 
 		 412 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03522  NADP-dependent malic enzyme  43.6 
 
 		 411 aa  324  2e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  41.59 
 
 		 756 aa  324  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4713  putative malate dehydrogenase  44.31 
 
 		 412 aa  324  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0242  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  44.67 
 
 		 414 aa  323  3e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3211  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  49.04 
 
 		 481 aa  323  3e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2900  malate dehydrogenase  46.49 
 
 		 394 aa  323  4e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0499  malate dehydrogenase  45.92 
 
 		 401 aa  322  8e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4734  malate dehydrogenase, putative  44.07 
 
 		 412 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4729  putative malate dehydrogenase  44.07 
 
 		 412 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4497  malate dehydrogenase  44.07 
 
 		 412 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4332  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  44.07 
 
 		 412 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4718  putative malate dehydrogenase  44.07 
 
 		 412 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4344  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  44.39 
 
 		 402 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2141  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  45.63 
 
 		 474 aa  321  1.9999999999999998e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4848  malate dehydrogenase  44.39 
 
 		 402 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0493  malate dehydrogenase  44.64 
 
 		 400 aa  320  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0112  NADP-dependent malic enzyme (NADP-me)  43.4 
 
 		 415 aa  320  3.9999999999999996e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1297  malate dehydrogenase  46.11 
 
 		 469 aa  318  7.999999999999999e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.428219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1455  malic enzyme  43.2 
 
 		 779 aa  318  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1195  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  44.02 
 
 		 463 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232421 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0366  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  44.68 
 
 		 468 aa  318  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  43.44 
 
 		 780 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0140  NAD-dependent malic enzyme  43.47 
 
 		 390 aa  318  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174768  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0359  malic enzyme  41.19 
 
 		 769 aa  317  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2321  malic enzyme  41.9 
 
 		 749 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0138  malic protein NAD-binding  45.41 
 
 		 391 aa  318  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000809828  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08210  malic enzyme  44.01 
 
 		 474 aa  317  3e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1888  malic enzyme  41.9 
 
 		 749 aa  317  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3432  malate dehydrogenase  47.93 
 
 		 479 aa  317  4e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231586  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0902  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  46.2 
 
 		 411 aa  315  7e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1269  malic enzyme  41.75 
 
 		 779 aa  315  8e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.525931  normal  0.614845 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0997  malic enzyme  42.96 
 
 		 777 aa  315  8e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.158987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3061  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))  42.69 
 
 		 440 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02395  malic enzyme  39.82 
 
 		 769 aa  315  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.766678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>