25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0394 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0394  formate dehydrogenase gamma subunit  100 
 
 		 239 aa  471  1e-132  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.041193 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0355  formate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit (formate dehydrogenase gamma subunit)  62.01 
 
 		 235 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1054  formate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit (formate dehydrogenase gamma subunit)  62.01 
 
 		 235 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.924923  normal  0.797197 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0160  formate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit (formate dehydrogenase gamma subunit)  59.83 
 
 		 258 aa  278  5e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1996  formate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit (formate dehydrogenase gamma subunit)  59.39 
 
 		 235 aa  277  1e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0143456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0952  formate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit (formate dehydrogenase gamma subunit)  57.89 
 
 		 233 aa  277  1e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.568502 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1410  formate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit (formate dehydrogenase gamma subunit)  48.03 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.182514  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4087  formate dehydrogenase-O subunit gamma  25.96 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0086  formate dehydrogenase-O subunit gamma  25.85 
 
 		 211 aa  52.4  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4126  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.68 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5342  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.68 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.412643 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4426  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.68 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4270  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.68 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4248  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.68 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.661793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4361  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.68 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4315  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.68 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03726  hypothetical protein  24.68 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03777  formate dehydrogenase-O, cytochrome b556 subunit  24.68 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4421  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.68 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4120  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.68 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4092  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.68 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4371  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.26 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4278  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.26 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1778  hypothetical protein  28.57 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000166899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1429  formate dehydrogenase-O subunit gamma  23.83 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>