10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0281 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0281  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  280  4.0000000000000003e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1944  paREP9  54.55 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.899867  hitchhiker  0.000000000000153546 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0560  paREP9  58.26 
 
 		 121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.112364  hitchhiker  0.0000107885 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1109  paREP9  56.52 
 
 		 121 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.566716  hitchhiker  0.000160386 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0043  paREP9  53.72 
 
 		 127 aa  126  9.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00594954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0001  paREP9  55.65 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.244204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0575  paREP9  55.65 
 
 		 121 aa  120  8e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.158938  normal  0.0596649 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0961  paREP9  54.78 
 
 		 121 aa  117  7e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.935966  hitchhiker  0.000271589 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1540  paREP9  55.93 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.552044 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1143  hypothetical protein  60.49 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0299368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>