48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0116 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0116  PaREP1 domain-containing protein  100 
 
 
166 aa  330  4e-90  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.441984 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0873  PaREP1 domain-containing protein  68.99 
 
 
161 aa  223  8e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1544  PaREP1 domain-containing protein  62.75 
 
 
167 aa  201  6e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.939018 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1316  PaREP1 domain-containing protein  54.61 
 
 
165 aa  168  3e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16604  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1463  PaREP1 domain-containing protein  50 
 
 
180 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0223  PaREP1 domain-containing protein  58.06 
 
 
160 aa  148  3e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.986183  normal  0.345709 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0390  PaREP1 domain-containing protein  49.37 
 
 
161 aa  143  9e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0971317 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1132  PaREP1 domain-containing protein  49.03 
 
 
163 aa  142  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.252197  normal  0.319661 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0555  PaREP1 domain-containing protein  52.14 
 
 
175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000150725  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0121  PaREP1 family protein  45.73 
 
 
173 aa  136  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00378279 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0163  PaREP1 domain-containing protein  51.9 
 
 
156 aa  135  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1348  PaREP1 domain-containing protein  50.34 
 
 
171 aa  133  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1095  PaREP1 domain-containing protein  43.83 
 
 
162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.220858 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2014  PaREP1 domain-containing protein  44.31 
 
 
186 aa  127  6e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00133149 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1267  PaREP1 domain-containing protein  46.81 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.852254 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1416  PaREP1 domain-containing protein  48.99 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0117064 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0950  PaREP1 domain-containing protein  50 
 
 
166 aa  115  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal  0.692047 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1373  PaREP1 domain-containing protein  45.03 
 
 
158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.550442 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1300  PaREP1 domain-containing protein  46.31 
 
 
185 aa  110  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0833015 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0469  PaREP1 family protein  43.86 
 
 
190 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0206869  hitchhiker  0.000000022653 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0566  PaREP1 domain-containing protein  45.16 
 
 
174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0238  PaREP1 domain-containing protein  46.67 
 
 
178 aa  107  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.904061  normal  0.189081 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1514  PaREP1 domain-containing protein  43.14 
 
 
188 aa  102  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.121861  normal  0.593103 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1430  PaREP1 domain-containing protein  40.12 
 
 
183 aa  99  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0697569 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0229  PaREP1 family protein  42.14 
 
 
182 aa  98.2  4e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.529373  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0464  PaREP1 domain-containing protein  41.89 
 
 
184 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0369  PaREP1 domain-containing protein  42.11 
 
 
182 aa  95.5  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0859081  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0508  PaREP1 family protein  38.71 
 
 
177 aa  95.1  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00973626 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0473  PaREP1 family protein  40.12 
 
 
209 aa  92  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123695  hitchhiker  0.0000000291135 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0282  PaREP1 domain-containing protein  47.58 
 
 
199 aa  90.9  8e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0491  PaREP1 domain-containing protein  40 
 
 
179 aa  89.4  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.971413 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0257  PaREP1 domain-containing protein  38.99 
 
 
180 aa  89.4  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0076  PaREP1 domain-containing protein  36.88 
 
 
183 aa  89  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.470948 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1474  PaREP1 domain-containing protein  40.85 
 
 
188 aa  87.8  6e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0934  PaREP1 domain-containing protein  42.22 
 
 
139 aa  86.3  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000142173  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0849  PaREP1 domain-containing protein  37.72 
 
 
190 aa  82  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.162193  normal  0.415152 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0258  PaREP1 domain-containing protein  38.51 
 
 
164 aa  82  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0403  PaREP1 domain-containing protein  42.31 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0695  PaREP1 domain-containing protein  41.72 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000720925 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0255  PaREP1 domain-containing protein  40.99 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0372  PaREP1 domain-containing protein  38.27 
 
 
187 aa  77.4  0.00000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.295091  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0334  PaREP1 domain-containing protein  40.74 
 
 
184 aa  77.4  0.00000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0363  PaREP1 domain-containing protein  40.74 
 
 
184 aa  77.4  0.00000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.162411  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0321  PaREP1 domain-containing protein  37.01 
 
 
157 aa  73.9  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1691  PaREP1 protein  34.75 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.346132  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0459  hypothetical protein  38.96 
 
 
81 aa  59.7  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0129  PaREP1 domain-containing protein  52.83 
 
 
119 aa  52  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.192151  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0157  hypothetical protein  35.14 
 
 
117 aa  47  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>